More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4646 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 708 aa  1444    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  64.59 
 
 		 693 aa  884    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  42.68 
 
 		 717 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  42.5 
 
 		 731 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 723 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  42.73 
 
 		 782 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  41.36 
 
 		 782 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  42.09 
 
 		 777 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  43.09 
 
 		 720 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  41.63 
 
 		 809 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 		 809 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  41.62 
 
 		 809 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 		 809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  41.53 
 
 		 774 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 		 721 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  41.38 
 
 		 721 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  40.45 
 
 		 774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  40.45 
 
 		 774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  40.45 
 
 		 774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  40.45 
 
 		 774 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  39.52 
 
 		 807 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 		 774 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  41.08 
 
 		 784 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  40.86 
 
 		 784 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  41.28 
 
 		 784 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 675 aa  336  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 696 aa  326  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 688 aa  313  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 731 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 704 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 703 aa  295  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.18 
 
 		 713 aa  293  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  30.28 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  31.11 
 
 		 690 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 710 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 711 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 782 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.46 
 
 		 705 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.47 
 
 		 666 aa  124  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 664 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 751 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 813 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 738 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 713 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 727 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 729 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 821 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 656 aa  102  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 709 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 730 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.43 
 
 		 713 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  22.4 
 
 		 846 aa  97.8  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 736 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  21.97 
 
 		 807 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.6 
 
 		 664 aa  95.5  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 715 aa  95.1  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.91 
 
 		 690 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 644 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 688 aa  92  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 798 aa  90.9  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 702 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 747 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.13 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 638 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 634 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 739 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  21.44 
 
 		 737 aa  87.8  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 728 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.24 
 
 		 702 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  21 
 
 		 718 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  21.22 
 
 		 740 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 692 aa  84.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.37 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 722 aa  84  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 722 aa  84  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 734 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  20.94 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  20.44 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  22.08 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  22.08 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  21.44 
 
 		 680 aa  81.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  22 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 733 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 792 aa  80.9  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  20.94 
 
 		 748 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.28 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  20.94 
 
 		 748 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.31 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>