More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1596 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1596  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 366 aa  762    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 705 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.56 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.54 
 
 		 620 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.59 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.25 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.33 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 662 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29 
 
 		 680 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 652 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 713 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.42 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 621 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.96 
 
 		 686 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.18 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 653 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  21.15 
 
 		 664 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.69 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.36 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.36 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.68 
 
 		 655 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.15 
 
 		 653 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.75 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.28 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 780 aa  59.7  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 719 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  23.01 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.33 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.99 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  24.45 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  25.48 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.77 
 
 		 665 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 760 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 691 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 619 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.17 
 
 		 665 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 742 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.17 
 
 		 665 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.17 
 
 		 665 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  26.83 
 
 		 623 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 681 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  27.78 
 
 		 641 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 675 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 634 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.33 
 
 		 700 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 735 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 702 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 638 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 629 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.43 
 
 		 716 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.41 
 
 		 712 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 641 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 645 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 671 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.26 
 
 		 739 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  21.45 
 
 		 659 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 748 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 702 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 669 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.27 
 
 		 656 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  23.81 
 
 		 697 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.04 
 
 		 698 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 874 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  37.5 
 
 		 749 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  22.91 
 
 		 732 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.53 
 
 		 797 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 635 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>