293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1858 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  100 
 
 
683 aa  1395    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.54 
 
 
690 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.41 
 
 
681 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.55 
 
 
688 aa  207  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.3 
 
 
695 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.92 
 
 
696 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  26.62 
 
 
697 aa  196  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.75 
 
 
696 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.65 
 
 
696 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
696 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
696 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.74 
 
 
676 aa  168  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.24 
 
 
686 aa  154  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
681 aa  147  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.18 
 
 
694 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.39 
 
 
677 aa  127  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  22.54 
 
 
676 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  22.54 
 
 
676 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.54 
 
 
676 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.41 
 
 
704 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  24.6 
 
 
693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.3 
 
 
668 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.37 
 
 
697 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.46 
 
 
660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.73 
 
 
734 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.21 
 
 
661 aa  115  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  25.56 
 
 
668 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.48 
 
 
660 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.68 
 
 
694 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.91 
 
 
689 aa  110  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  24.08 
 
 
778 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.37 
 
 
778 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.1 
 
 
698 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.35 
 
 
693 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.14 
 
 
657 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 
684 aa  101  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.76 
 
 
779 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
649 aa  100  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
665 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  24.3 
 
 
659 aa  94  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.3 
 
 
849 aa  94  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.27 
 
 
783 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.28 
 
 
722 aa  91.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 
791 aa  89.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.38 
 
 
490 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
654 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.02 
 
 
669 aa  84.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  21.43 
 
 
654 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.85 
 
 
646 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 
652 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  21.5 
 
 
661 aa  79.7  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 
685 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.72 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.95 
 
 
859 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  22.73 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  22.6 
 
 
857 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  22.03 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  30.68 
 
 
851 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 
800 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.1 
 
 
712 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
687 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  23.55 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  22.77 
 
 
746 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  22.9 
 
 
746 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.11 
 
 
851 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21 
 
 
716 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
668 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  22.77 
 
 
746 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  22.77 
 
 
746 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.54 
 
 
862 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  22.77 
 
 
746 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  20.62 
 
 
744 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  22.61 
 
 
692 aa  68.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.52 
 
 
759 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.97 
 
 
655 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
644 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  20.24 
 
 
762 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  26.64 
 
 
644 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
634 aa  64.3  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  21.58 
 
 
713 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  21.59 
 
 
728 aa  64.3  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 
374 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  27.04 
 
 
644 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 
771 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 
636 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
702 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
742 aa  61.6  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 
685 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.19 
 
 
687 aa  61.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
693 aa  60.8  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  19.7 
 
 
892 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 
693 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  20.69 
 
 
752 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.92 
 
 
730 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 
663 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.52 
 
 
743 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.82 
 
 
754 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.33 
 
 
734 aa  58.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>