246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0996 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  100 
 
 
659 aa  1357    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  65.05 
 
 
668 aa  902    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  36.29 
 
 
693 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.89 
 
 
677 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  31.99 
 
 
697 aa  270  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 
681 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.02 
 
 
657 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  29.43 
 
 
668 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
649 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
687 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
668 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
667 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.46 
 
 
652 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  27.4 
 
 
644 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 
693 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
644 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.48 
 
 
646 aa  171  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  25.68 
 
 
644 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  27.69 
 
 
490 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 
743 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.56 
 
 
661 aa  154  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.09 
 
 
654 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
684 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.05 
 
 
676 aa  150  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  25.76 
 
 
692 aa  148  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
756 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
665 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
654 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.31 
 
 
696 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
652 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.25 
 
 
696 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  25.17 
 
 
697 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 
300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.52 
 
 
695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.8 
 
 
696 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.94 
 
 
696 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.75 
 
 
681 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.67 
 
 
696 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 
683 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.76 
 
 
688 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.76 
 
 
704 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.01 
 
 
690 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 
752 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.52 
 
 
694 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  25.4 
 
 
712 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.21 
 
 
783 aa  104  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.15 
 
 
660 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.15 
 
 
660 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  24.3 
 
 
683 aa  94  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.77 
 
 
694 aa  94  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  32.67 
 
 
744 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.54 
 
 
778 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
686 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.06 
 
 
689 aa  90.5  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.18 
 
 
734 aa  90.5  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.08 
 
 
685 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.8 
 
 
661 aa  87.4  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  23.54 
 
 
778 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  36.75 
 
 
169 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  24.01 
 
 
728 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  21.03 
 
 
771 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  28.16 
 
 
730 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.68 
 
 
764 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  28.17 
 
 
737 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.96 
 
 
752 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.23 
 
 
867 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.13 
 
 
737 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.89 
 
 
749 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  22.37 
 
 
764 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.4 
 
 
739 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.57 
 
 
714 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.31 
 
 
739 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.43 
 
 
849 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  23.24 
 
 
739 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.92 
 
 
859 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.23 
 
 
722 aa  75.5  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.78 
 
 
739 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.88 
 
 
737 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.19 
 
 
779 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  35.71 
 
 
851 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.78 
 
 
739 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 
800 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.82 
 
 
693 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.03 
 
 
717 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  34.3 
 
 
851 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.44 
 
 
862 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.81 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  21.5 
 
 
857 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.25 
 
 
698 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.53 
 
 
862 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.28 
 
 
862 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.34 
 
 
754 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.18 
 
 
861 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 
698 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  20.47 
 
 
676 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  26.53 
 
 
314 aa  66.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.82 
 
 
766 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.64 
 
 
759 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  22.34 
 
 
712 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>