163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1943 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  98.13 
 
 		 668 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 374 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.14 
 
 		 657 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 649 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 681 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  28.45 
 
 		 692 aa  132  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  33.71 
 
 		 169 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  35.03 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 687 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 665 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  25.8 
 
 		 693 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 652 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  26.32 
 
 		 668 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  26.46 
 
 		 659 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.74 
 
 		 734 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 652 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  25.08 
 
 		 654 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  25.08 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 684 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.06 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  24.92 
 
 		 728 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25 
 
 		 749 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.06 
 
 		 696 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.05 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  21.94 
 
 		 683 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.7 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.74 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.15 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.59 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 784 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 764 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  26.67 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.55 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.06 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.48 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.04 
 
 		 704 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 784 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.7 
 
 		 696 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 737 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.11 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.34 
 
 		 696 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 693 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.17 
 
 		 639 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  27.24 
 
 		 687 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 		 707 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 979 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 628 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 602 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  21.5 
 
 		 644 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 756 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 702 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.17 
 
 		 646 aa  52.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  20.8 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 649 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 702 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 742 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.74 
 
 		 713 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.05 
 
 		 862 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 708 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 772 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 736 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 772 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 683 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 635 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.08 
 
 		 689 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.12 
 
 		 695 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 668 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 678 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 761 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 718 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 724 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 701 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 661 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 788 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  32 
 
 		 807 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 746 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25 
 
 		 686 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 794 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 724 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 697 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.7 
 
 		 862 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.18 
 
 		 712 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 698 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 705 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 698 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 698 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  26.67 
 
 		 746 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.58 
 
 		 746 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>