35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06116 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  349  8.999999999999999e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  40.35 
 
 		 657 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 668 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 374 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 649 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  35.93 
 
 		 668 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  36.75 
 
 		 659 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  35.85 
 
 		 652 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.71 
 
 		 677 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.88 
 
 		 697 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 667 aa  68.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 693 aa  68.2  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  25.56 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 684 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  26.47 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 687 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 665 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 683 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 652 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.78 
 
 		 734 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 654 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.31 
 
 		 694 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 759 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 759 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.25 
 
 		 731 aa  44.7  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 756 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.81 
 
 		 686 aa  44.3  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.36 
 
 		 654 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.43 
 
 		 728 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 672 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.36 
 
 		 661 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 743 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  25.58 
 
 		 730 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 796 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>