110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0387 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  100 
 
 
683 aa  1378    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 
667 aa  301  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 
693 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 
654 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.55 
 
 
657 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.57 
 
 
697 aa  154  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
681 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 
652 aa  142  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
649 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.9 
 
 
677 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  27.19 
 
 
490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.71 
 
 
668 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
687 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  24.82 
 
 
659 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  24.96 
 
 
693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.62 
 
 
654 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
665 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.86 
 
 
661 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
756 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.96 
 
 
676 aa  96.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.01 
 
 
668 aa  95.5  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
652 aa  94.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
668 aa  94.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.37 
 
 
690 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.5 
 
 
688 aa  93.2  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.78 
 
 
696 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  25.17 
 
 
644 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.03 
 
 
696 aa  90.5  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  24.44 
 
 
644 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.84 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.89 
 
 
696 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.49 
 
 
704 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.19 
 
 
696 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.3 
 
 
694 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.04 
 
 
646 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 
743 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.1 
 
 
695 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.34 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.19 
 
 
783 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  22.58 
 
 
697 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  29.14 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
684 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.7 
 
 
660 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  20.27 
 
 
692 aa  67.4  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.99 
 
 
661 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.41 
 
 
660 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.13 
 
 
722 aa  66.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  20.97 
 
 
716 aa  62  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.82 
 
 
694 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.03 
 
 
778 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  21.5 
 
 
730 aa  61.6  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.71 
 
 
669 aa  61.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  22.83 
 
 
728 aa  60.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.57 
 
 
685 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.94 
 
 
734 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  22.3 
 
 
778 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  25.88 
 
 
314 aa  58.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.53 
 
 
759 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  32.73 
 
 
676 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  32.73 
 
 
676 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.73 
 
 
676 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0590  hemoglobin and hemoglobin-haptoglobin binding protein B  28.72 
 
 
998 aa  55.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 
752 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 
670 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.53 
 
 
862 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.62 
 
 
717 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.78 
 
 
686 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 
800 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.46 
 
 
849 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.2 
 
 
693 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  27.41 
 
 
712 aa  52.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.51 
 
 
779 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.5 
 
 
862 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.7 
 
 
731 aa  51.2  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.55 
 
 
885 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.14 
 
 
764 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
374 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 
731 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  22.76 
 
 
771 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
683 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  24.58 
 
 
891 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.3 
 
 
892 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  29.14 
 
 
764 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.87 
 
 
859 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.5 
 
 
862 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.6 
 
 
698 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.77 
 
 
867 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.05 
 
 
689 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  24.73 
 
 
640 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.68 
 
 
737 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.93 
 
 
685 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  21.21 
 
 
851 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.28 
 
 
892 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
675 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.56 
 
 
744 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  29.73 
 
 
830 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.25 
 
 
630 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.73 
 
 
783 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>