148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2622 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  68.35 
 
 
752 aa  1042    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
743 aa  1501    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  73.68 
 
 
756 aa  1123    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 
644 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  37.5 
 
 
644 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 
652 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 
644 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.79 
 
 
654 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.48 
 
 
661 aa  212  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
665 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
649 aa  184  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
681 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 
652 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.78 
 
 
657 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  25.23 
 
 
659 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
668 aa  153  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  24.28 
 
 
668 aa  144  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.99 
 
 
646 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  27.78 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.33 
 
 
668 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  34.36 
 
 
300 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
693 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 
684 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
687 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  24.74 
 
 
692 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
667 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.59 
 
 
867 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.95 
 
 
696 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.07 
 
 
696 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.68 
 
 
696 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.49 
 
 
859 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.72 
 
 
676 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.78 
 
 
690 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  40.97 
 
 
654 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.73 
 
 
695 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.54 
 
 
696 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.7 
 
 
857 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.19 
 
 
862 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.05 
 
 
696 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.01 
 
 
861 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27 
 
 
862 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  27.41 
 
 
697 aa  97.4  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.72 
 
 
688 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.41 
 
 
862 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.95 
 
 
681 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.76 
 
 
697 aa  92  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.56 
 
 
677 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  29.85 
 
 
693 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
683 aa  82  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  28.71 
 
 
698 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.95 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  25.76 
 
 
693 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.36 
 
 
694 aa  77.4  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.88 
 
 
1186 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
808 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 
771 aa  72  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 
808 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  29.95 
 
 
712 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 
817 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.74 
 
 
849 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.38 
 
 
743 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.43 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  27.57 
 
 
764 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  27.57 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.83 
 
 
717 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  25.48 
 
 
314 aa  65.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.24 
 
 
759 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.27 
 
 
734 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  24.22 
 
 
851 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  27.32 
 
 
778 aa  64.3  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  23.33 
 
 
730 aa  64.3  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.65 
 
 
744 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  24.81 
 
 
992 aa  60.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.99 
 
 
660 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
809 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  39.69 
 
 
827 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.27 
 
 
783 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.99 
 
 
660 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  26.44 
 
 
737 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.77 
 
 
778 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.31 
 
 
661 aa  58.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 
819 aa  57.8  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.08 
 
 
851 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 
863 aa  57.4  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.39 
 
 
885 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26 
 
 
728 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.33 
 
 
891 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.86 
 
 
676 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 
778 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
739 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.74 
 
 
779 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.2 
 
 
737 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
739 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.58 
 
 
676 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
739 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  23.58 
 
 
676 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.97 
 
 
892 aa  54.3  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
739 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
973 aa  54.3  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.77 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>