239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1308 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  85.21 
 
 
737 aa  1328    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  72.39 
 
 
744 aa  1115    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  47.83 
 
 
730 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.29 
 
 
739 aa  1418    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.15 
 
 
739 aa  1416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  85.89 
 
 
737 aa  1341    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.15 
 
 
739 aa  1419    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.29 
 
 
739 aa  1421    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
737 aa  1525    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.09 
 
 
849 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  30.65 
 
 
851 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.38 
 
 
851 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  30.55 
 
 
314 aa  164  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
704 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
681 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.14 
 
 
676 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.66 
 
 
688 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 
800 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.6 
 
 
696 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  22.49 
 
 
697 aa  124  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.7 
 
 
681 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.59 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.59 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.76 
 
 
696 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.71 
 
 
696 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
695 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.16 
 
 
686 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  24.13 
 
 
670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.59 
 
 
689 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.77 
 
 
690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.58 
 
 
696 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.82 
 
 
661 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.58 
 
 
696 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.79 
 
 
657 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 
771 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.22 
 
 
697 aa  105  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.18 
 
 
677 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.21 
 
 
490 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
693 aa  98.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
684 aa  97.8  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 
652 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.7 
 
 
712 aa  94  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.29 
 
 
668 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.49 
 
 
668 aa  93.6  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.79 
 
 
646 aa  91.3  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.03 
 
 
685 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.02 
 
 
728 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.28 
 
 
734 aa  88.6  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
687 aa  84  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 
667 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.52 
 
 
867 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.5 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.79 
 
 
693 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.46 
 
 
669 aa  79.7  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  29.45 
 
 
676 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  28.83 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.83 
 
 
676 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 
654 aa  77  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
668 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 
300 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.17 
 
 
698 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  19.72 
 
 
722 aa  75.5  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  28.88 
 
 
659 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.04 
 
 
862 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.04 
 
 
862 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.7 
 
 
759 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  22.4 
 
 
693 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.27 
 
 
778 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.21 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.87 
 
 
717 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.2 
 
 
859 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.65 
 
 
694 aa  68.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.89 
 
 
783 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  19.81 
 
 
743 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  37.93 
 
 
861 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.91 
 
 
857 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  29.3 
 
 
654 aa  65.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.84 
 
 
661 aa  64.7  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  30.59 
 
 
778 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.27 
 
 
779 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.08 
 
 
716 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  26.56 
 
 
692 aa  62.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  21.57 
 
 
739 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  25.51 
 
 
750 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.82 
 
 
751 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  26.82 
 
 
751 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.82 
 
 
751 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 
720 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  30 
 
 
724 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.26 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.26 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 
727 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 
677 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 
722 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.32 
 
 
714 aa  59.3  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  36.84 
 
 
764 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.41 
 
 
724 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.09 
 
 
724 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.41 
 
 
724 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>