236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1381 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  85.25 
 
 
737 aa  1323    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  48.76 
 
 
730 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  98.65 
 
 
739 aa  1509    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  72.04 
 
 
744 aa  1108    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
739 aa  1528    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  98.11 
 
 
739 aa  1501    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  87.01 
 
 
737 aa  1340    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  99.05 
 
 
739 aa  1518    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.15 
 
 
737 aa  1419    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.09 
 
 
849 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.65 
 
 
851 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  30.65 
 
 
851 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  31.05 
 
 
314 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 
704 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
681 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.17 
 
 
676 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.7 
 
 
688 aa  134  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  36.87 
 
 
800 aa  132  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.82 
 
 
697 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.35 
 
 
689 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
649 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.9 
 
 
690 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.86 
 
 
696 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.29 
 
 
695 aa  124  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.03 
 
 
696 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.81 
 
 
681 aa  121  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.29 
 
 
696 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.08 
 
 
660 aa  118  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.08 
 
 
660 aa  118  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 
670 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.19 
 
 
686 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 
771 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22 
 
 
696 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.27 
 
 
657 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.36 
 
 
697 aa  108  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.14 
 
 
696 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.12 
 
 
677 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.61 
 
 
661 aa  104  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 
684 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
693 aa  100  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.39 
 
 
490 aa  98.2  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.26 
 
 
712 aa  97.8  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 
652 aa  97.8  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.22 
 
 
685 aa  94.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.16 
 
 
668 aa  92.8  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  26.83 
 
 
668 aa  91.3  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
734 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
687 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.26 
 
 
646 aa  88.2  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 
654 aa  88.2  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.99 
 
 
867 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
667 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.84 
 
 
693 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.1 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.51 
 
 
694 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  30.92 
 
 
676 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.26 
 
 
676 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  30.26 
 
 
676 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.85 
 
 
669 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  27.31 
 
 
659 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.01 
 
 
779 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.67 
 
 
862 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  19.78 
 
 
722 aa  74.3  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.63 
 
 
862 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.58 
 
 
759 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.45 
 
 
778 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.9 
 
 
862 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.81 
 
 
783 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.96 
 
 
698 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.22 
 
 
861 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.44 
 
 
859 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.68 
 
 
717 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  22.26 
 
 
739 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.49 
 
 
694 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  28.57 
 
 
778 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  31.19 
 
 
661 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.32 
 
 
743 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.27 
 
 
714 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  22.08 
 
 
747 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  28.04 
 
 
857 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  30.73 
 
 
654 aa  65.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  23.66 
 
 
693 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.26 
 
 
755 aa  65.1  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.25 
 
 
716 aa  64.7  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
791 aa  64.3  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
683 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  21.96 
 
 
720 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
800 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 
727 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 
722 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  29.52 
 
 
692 aa  61.2  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  28.89 
 
 
764 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.04 
 
 
715 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.4 
 
 
892 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.4 
 
 
892 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
688 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.41 
 
 
764 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  30 
 
 
724 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>