253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2503 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  48.23 
 
 
730 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  70.86 
 
 
737 aa  1101    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  72.04 
 
 
739 aa  1108    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  72.04 
 
 
739 aa  1107    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  100 
 
 
744 aa  1538    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  70.45 
 
 
737 aa  1102    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  71.63 
 
 
739 aa  1100    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  72.18 
 
 
739 aa  1110    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  72.39 
 
 
737 aa  1115    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.85 
 
 
849 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  31.38 
 
 
851 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  31.53 
 
 
851 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.72 
 
 
704 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  31.37 
 
 
314 aa  151  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.24 
 
 
681 aa  144  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.03 
 
 
676 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 
800 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.27 
 
 
696 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.2 
 
 
690 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.25 
 
 
696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.9 
 
 
696 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 
693 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.37 
 
 
686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.5 
 
 
688 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.65 
 
 
697 aa  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.64 
 
 
677 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.97 
 
 
695 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.77 
 
 
696 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.54 
 
 
696 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25 
 
 
689 aa  124  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
681 aa  124  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 
649 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.41 
 
 
657 aa  118  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.86 
 
 
697 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  25.74 
 
 
490 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  25 
 
 
667 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  24.04 
 
 
771 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 
652 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
684 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.95 
 
 
734 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.32 
 
 
712 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  23.26 
 
 
670 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.51 
 
 
660 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.86 
 
 
661 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.51 
 
 
660 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.4 
 
 
685 aa  98.2  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.57 
 
 
717 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 
687 aa  94.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.55 
 
 
862 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  32.67 
 
 
659 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  30.33 
 
 
668 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.04 
 
 
778 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  22.72 
 
 
693 aa  91.3  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  23.2 
 
 
693 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  21.73 
 
 
778 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.91 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.98 
 
 
862 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.47 
 
 
862 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.46 
 
 
728 aa  82.4  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
654 aa  82  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.1 
 
 
759 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.91 
 
 
861 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.78 
 
 
716 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 
668 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.44 
 
 
779 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.22 
 
 
743 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.19 
 
 
859 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  22.6 
 
 
739 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.54 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.51 
 
 
676 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  23.1 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.4 
 
 
857 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.65 
 
 
722 aa  71.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  22.92 
 
 
654 aa  72  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30 
 
 
694 aa  71.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  23.51 
 
 
676 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.51 
 
 
676 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  20.62 
 
 
683 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.78 
 
 
867 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.22 
 
 
669 aa  69.3  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  20.78 
 
 
712 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  20.43 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  20.11 
 
 
783 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  21.14 
 
 
747 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.7 
 
 
694 aa  64.7  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
668 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 
683 aa  64.3  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  21.59 
 
 
764 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.68 
 
 
892 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  28.29 
 
 
692 aa  62.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.68 
 
 
892 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 
743 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25 
 
 
719 aa  58.9  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.67 
 
 
1186 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  22.82 
 
 
885 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  25.28 
 
 
644 aa  57.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  28.38 
 
 
750 aa  57.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  26.94 
 
 
742 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  25.49 
 
 
644 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>