243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1580 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  100 
 
 
737 aa  1525    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  85.25 
 
 
739 aa  1323    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  48.65 
 
 
730 aa  687    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  70.86 
 
 
744 aa  1101    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  84.84 
 
 
739 aa  1317    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  84.71 
 
 
739 aa  1314    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  91.45 
 
 
737 aa  1422    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  85.25 
 
 
739 aa  1324    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  85.21 
 
 
737 aa  1328    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.81 
 
 
849 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  30.61 
 
 
851 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.48 
 
 
851 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  32.99 
 
 
314 aa  168  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.97 
 
 
704 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.17 
 
 
676 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 
681 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  35.6 
 
 
800 aa  132  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.5 
 
 
697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
649 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.39 
 
 
677 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.14 
 
 
690 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.25 
 
 
681 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.16 
 
 
688 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.51 
 
 
696 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.62 
 
 
689 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.94 
 
 
696 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  22.54 
 
 
697 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.48 
 
 
695 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.96 
 
 
696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  23.18 
 
 
670 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.61 
 
 
660 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.61 
 
 
660 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.4 
 
 
657 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.46 
 
 
686 aa  111  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.82 
 
 
696 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  20.92 
 
 
771 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.82 
 
 
696 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
693 aa  102  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.52 
 
 
646 aa  101  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.54 
 
 
661 aa  101  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
667 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.09 
 
 
685 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  23.85 
 
 
490 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.35 
 
 
712 aa  94.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 
652 aa  94.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  23.55 
 
 
668 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 
734 aa  91.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 
684 aa  90.5  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.45 
 
 
668 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
687 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.85 
 
 
693 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.89 
 
 
867 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.78 
 
 
698 aa  82  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  21.01 
 
 
739 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.13 
 
 
728 aa  80.9  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 
654 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.99 
 
 
743 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  28.17 
 
 
659 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.03 
 
 
717 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.11 
 
 
694 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  30.26 
 
 
676 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
668 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.05 
 
 
861 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  29.61 
 
 
676 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.61 
 
 
676 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.7 
 
 
694 aa  70.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.06 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.32 
 
 
669 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.26 
 
 
862 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.26 
 
 
759 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.13 
 
 
862 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.9 
 
 
859 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.48 
 
 
755 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  31.63 
 
 
654 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  31.05 
 
 
661 aa  65.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  20.82 
 
 
716 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  27.22 
 
 
693 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.51 
 
 
714 aa  65.1  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  20.77 
 
 
800 aa  64.7  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.26 
 
 
783 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  21.68 
 
 
747 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.75 
 
 
778 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  37.89 
 
 
764 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  29.3 
 
 
778 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  33.33 
 
 
857 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  36.84 
 
 
764 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  21.75 
 
 
712 aa  60.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  31.52 
 
 
692 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.77 
 
 
730 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 
743 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  20.87 
 
 
930 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.71 
 
 
762 aa  58.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.86 
 
 
751 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.86 
 
 
751 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  24.68 
 
 
989 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
1018 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  21.26 
 
 
728 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.29 
 
 
751 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
727 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>