106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3056 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  100 
 
 		 644 aa  1291    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  57.1 
 
 		 652 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  97.83 
 
 		 644 aa  1236    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  87.73 
 
 		 644 aa  1100    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 756 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 752 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 665 aa  240  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.53 
 
 		 654 aa  237  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.36 
 
 		 661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 649 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 652 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  28.15 
 
 		 668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  25.96 
 
 		 659 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.83 
 
 		 657 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 668 aa  160  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  29.17 
 
 		 490 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 667 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  33.59 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 654 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.6 
 
 		 677 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.8 
 
 		 697 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 693 aa  113  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  23.94 
 
 		 693 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  32.33 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  35.9 
 
 		 646 aa  101  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.49 
 
 		 704 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 683 aa  94.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  23.19 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  29.08 
 
 		 698 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.35 
 
 		 696 aa  77  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.59 
 
 		 689 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  28.81 
 
 		 693 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.07 
 
 		 681 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.09 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.23 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.79 
 
 		 696 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  29.1 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.5 
 
 		 695 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.2 
 
 		 676 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  26.64 
 
 		 683 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.71 
 
 		 849 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.45 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  24.41 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.34 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  25 
 
 		 697 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  26.4 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25 
 
 		 861 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.45 
 
 		 696 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  26 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  27.06 
 
 		 764 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.3 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.65 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.88 
 
 		 749 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.82 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.03 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.61 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.49 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.31 
 
 		 759 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  28.24 
 
 		 314 aa  55.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.15 
 
 		 778 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.33 
 
 		 862 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.74 
 
 		 686 aa  54.7  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.46 
 
 		 685 aa  54.3  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.6 
 
 		 862 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  28.25 
 
 		 778 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 771 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.33 
 
 		 779 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  23.36 
 
 		 730 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  28.96 
 
 		 830 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.96 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.35 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  27.87 
 
 		 830 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 602 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.3 
 
 		 724 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 702 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 702 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 698 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.27 
 
 		 718 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  35.29 
 
 		 757 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  34.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  23.38 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  40.91 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.79 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.36 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.19 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 753 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 982 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  23.62 
 
 		 737 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.54 
 
 		 892 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.44 
 
 		 783 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 800 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  23.84 
 
 		 851 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  24.21 
 
 		 851 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>