More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3560 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 695 aa  1433    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 697 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 699 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 672 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  34.65 
 
 		 688 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  33.86 
 
 		 688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  33.69 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  33.14 
 
 		 723 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  32.11 
 
 		 710 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  32.81 
 
 		 719 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  32.54 
 
 		 688 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  31.78 
 
 		 724 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  33.19 
 
 		 726 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  33.49 
 
 		 687 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  32.54 
 
 		 753 aa  301  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  32.76 
 
 		 745 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  32.9 
 
 		 749 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  32.9 
 
 		 749 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  32.95 
 
 		 745 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  32.95 
 
 		 745 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  32.95 
 
 		 745 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  32.52 
 
 		 687 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  32.18 
 
 		 713 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  32.09 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  31.1 
 
 		 710 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  31.1 
 
 		 710 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  31.1 
 
 		 710 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 681 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  32.22 
 
 		 667 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  31.59 
 
 		 710 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  31.26 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  32.87 
 
 		 686 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  30.52 
 
 		 691 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  32.32 
 
 		 725 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  31.1 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  32.32 
 
 		 698 aa  278  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  31.22 
 
 		 681 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  31.22 
 
 		 681 aa  273  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  31.22 
 
 		 686 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  31.4 
 
 		 684 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  31.3 
 
 		 669 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  30.11 
 
 		 667 aa  264  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  30.49 
 
 		 668 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  30.76 
 
 		 668 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  30.78 
 
 		 662 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  31.17 
 
 		 661 aa  253  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  29.92 
 
 		 663 aa  253  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  28.42 
 
 		 699 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 702 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 668 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.75 
 
 		 625 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 702 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 768 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 696 aa  157  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 702 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 718 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.31 
 
 		 665 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 673 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 716 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 698 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 684 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 685 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 713 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.66 
 
 		 708 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 685 aa  100  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.33 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 713 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 713 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.79 
 
 		 867 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 683 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 713 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 793 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 713 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.65 
 
 		 687 aa  89.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.18 
 
 		 775 aa  88.6  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  20.29 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.27 
 
 		 728 aa  85.5  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.66 
 
 		 862 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 749 aa  85.1  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.94 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.25 
 
 		 862 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 741 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 766 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  21.82 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  28.17 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  23.44 
 
 		 772 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 780 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.45 
 
 		 764 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.2 
 
 		 734 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 769 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>