91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0425 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 
625 aa  1280    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.65 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  27.75 
 
 
695 aa  174  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 
697 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  24.13 
 
 
667 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.84 
 
 
723 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23.89 
 
 
719 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  23.66 
 
 
688 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  23.63 
 
 
687 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  24.73 
 
 
686 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  23.97 
 
 
688 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  25.09 
 
 
676 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  23.66 
 
 
688 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  25.09 
 
 
676 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.67 
 
 
688 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  32.37 
 
 
662 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  28.09 
 
 
661 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
696 aa  87.4  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  34.36 
 
 
698 aa  87  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  34.36 
 
 
725 aa  87  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
749 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
749 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.32 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.95 
 
 
753 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  22.78 
 
 
668 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  25.77 
 
 
667 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  27.37 
 
 
668 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.58 
 
 
687 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 
708 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  20.98 
 
 
713 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  21.71 
 
 
724 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
713 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  28.29 
 
 
699 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  32.98 
 
 
710 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  22.6 
 
 
713 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 
713 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  26.29 
 
 
709 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  26.59 
 
 
684 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.08 
 
 
710 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 
672 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  28.74 
 
 
726 aa  73.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
713 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  31.55 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  30.86 
 
 
691 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.15 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.15 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.15 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
716 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  24.52 
 
 
669 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  22.22 
 
 
681 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  22.22 
 
 
681 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  22.22 
 
 
686 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  23.72 
 
 
708 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  25 
 
 
717 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 
702 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
702 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
768 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
760 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
702 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 
713 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 
713 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
714 aa  54.3  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
713 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.43 
 
 
750 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
769 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
793 aa  51.2  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  26.87 
 
 
744 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
668 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.12 
 
 
744 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 
673 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  29.57 
 
 
688 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.94 
 
 
701 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.15 
 
 
744 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.76 
 
 
697 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
767 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
741 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.56 
 
 
746 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
684 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
766 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
683 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  21.88 
 
 
788 aa  45.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
744 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
635 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
749 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
750 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>