156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3452 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 699 aa  1400    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  34.74 
 
 		 695 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 697 aa  310  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 672 aa  291  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  31.89 
 
 		 698 aa  251  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  31.74 
 
 		 725 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  31.41 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  31.62 
 
 		 687 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 681 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  31.34 
 
 		 709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  30.33 
 
 		 749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  28.7 
 
 		 684 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  30.92 
 
 		 745 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  30.23 
 
 		 749 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  30.97 
 
 		 686 aa  233  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  30.2 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  30.2 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  30.2 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  30.92 
 
 		 753 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  29.89 
 
 		 669 aa  231  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  30.33 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  30.33 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  30.33 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  29.82 
 
 		 687 aa  230  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  30.26 
 
 		 710 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  29.52 
 
 		 688 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  29.77 
 
 		 688 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  29.38 
 
 		 688 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  31.48 
 
 		 713 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  29.97 
 
 		 723 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  29.17 
 
 		 688 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  29.61 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  29.28 
 
 		 710 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  29 
 
 		 726 aa  210  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.46 
 
 		 681 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  27.46 
 
 		 686 aa  208  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27.31 
 
 		 681 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  29.33 
 
 		 667 aa  204  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  27.3 
 
 		 676 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.52 
 
 		 691 aa  197  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  27.15 
 
 		 676 aa  197  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  27.62 
 
 		 661 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  27.08 
 
 		 662 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  26.34 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 668 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  28.04 
 
 		 699 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  26.92 
 
 		 668 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  26.77 
 
 		 668 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 668 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  25.84 
 
 		 663 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 760 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 702 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 702 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 696 aa  134  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.64 
 
 		 625 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.91 
 
 		 665 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 684 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 673 aa  114  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 718 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.22 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 750 aa  101  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 683 aa  95.1  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 729 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.14 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  22.43 
 
 		 772 aa  84.7  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 780 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 698 aa  78.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.68 
 
 		 708 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 714 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 705 aa  77.8  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.31 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 769 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 716 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.52 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 758 aa  68.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  21.25 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.55 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.44 
 
 		 750 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.36 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.32 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.2 
 
 		 764 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>