293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1392 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  52.17 
 
 
688 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  51.94 
 
 
688 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  48.38 
 
 
710 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  51.47 
 
 
688 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  51.01 
 
 
688 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
691 aa  1426    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  50 
 
 
723 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  50.15 
 
 
719 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  48.6 
 
 
676 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  48.44 
 
 
676 aa  611  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  47.91 
 
 
681 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  47.91 
 
 
686 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  46.89 
 
 
684 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  47.6 
 
 
681 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  46.37 
 
 
726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  46.39 
 
 
687 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  46.61 
 
 
687 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  45.96 
 
 
669 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  46.15 
 
 
709 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  46.04 
 
 
713 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  46.56 
 
 
753 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  45.96 
 
 
710 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  45.96 
 
 
710 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  45.96 
 
 
710 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  45.62 
 
 
749 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  45.62 
 
 
749 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  45.76 
 
 
745 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  45.91 
 
 
710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  45.17 
 
 
745 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  45.17 
 
 
745 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  45.17 
 
 
745 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  47 
 
 
725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  46.69 
 
 
698 aa  561  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  45.21 
 
 
724 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  35.92 
 
 
686 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
668 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  34.53 
 
 
668 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  34.55 
 
 
662 aa  350  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  34.39 
 
 
668 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  33.91 
 
 
661 aa  349  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  35.19 
 
 
667 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  34.35 
 
 
667 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  34.56 
 
 
663 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  30.73 
 
 
695 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.01 
 
 
665 aa  252  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 
672 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
697 aa  226  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
699 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
681 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
768 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
760 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
668 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  22.63 
 
 
699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
702 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
702 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 
661 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 
673 aa  106  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
767 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 
718 aa  104  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 
685 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
716 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
750 aa  97.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.18 
 
 
708 aa  97.4  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
702 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 
705 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 
780 aa  87.4  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.89 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
766 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 
793 aa  84.3  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
721 aa  84.7  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
713 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.35 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 
696 aa  80.9  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
749 aa  77.4  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
713 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 
685 aa  75.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.11 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
705 aa  74.7  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 
729 aa  73.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  30.04 
 
 
687 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.27 
 
 
862 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  29.95 
 
 
764 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
713 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
713 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.41 
 
 
764 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.44 
 
 
862 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.91 
 
 
867 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
680 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.45 
 
 
775 aa  70.5  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
713 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  30.22 
 
 
857 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  31.15 
 
 
861 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.89 
 
 
862 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.67 
 
 
859 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3241  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 
630 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 
769 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.89 
 
 
759 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
698 aa  68.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>