More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0239 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  63.99 
 
 		 669 aa  890    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 681 aa  1404    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  56.1 
 
 		 676 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  58.45 
 
 		 688 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  56.26 
 
 		 676 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  51.85 
 
 		 698 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  51.84 
 
 		 745 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 		 710 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  98.69 
 
 		 686 aa  1393    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  58.89 
 
 		 688 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  51.7 
 
 		 725 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  54.52 
 
 		 749 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  69.22 
 
 		 684 aa  1000    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  59.45 
 
 		 710 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  52.23 
 
 		 687 aa  673    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  99.56 
 
 		 681 aa  1399    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  53.95 
 
 		 710 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  53 
 
 		 753 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  51.84 
 
 		 745 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  56.52 
 
 		 719 aa  791    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  53.95 
 
 		 713 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  51.84 
 
 		 745 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  50.64 
 
 		 724 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 		 710 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  53.8 
 
 		 687 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  55.09 
 
 		 726 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 		 709 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  56.02 
 
 		 723 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  58.08 
 
 		 688 aa  805    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  57.73 
 
 		 688 aa  799    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 		 710 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  52.24 
 
 		 745 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  54.52 
 
 		 749 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  47.76 
 
 		 691 aa  608  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  41.27 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.06 
 
 		 661 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  36.68 
 
 		 662 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  38.57 
 
 		 667 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 668 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.26 
 
 		 668 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  37.58 
 
 		 668 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  34.74 
 
 		 663 aa  379  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  34.47 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 672 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.22 
 
 		 695 aa  273  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.62 
 
 		 665 aa  237  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 697 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 681 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 668 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 760 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 768 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.14 
 
 		 699 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 702 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 661 aa  127  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 702 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 750 aa  95.1  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 775 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 713 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.05 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 751 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.47 
 
 		 701 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 751 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 713 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  41.38 
 
 		 185 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 766 aa  73.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 793 aa  71.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 741 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 780 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.58 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.12 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.95 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 724 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.22 
 
 		 625 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  20.88 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 685 aa  63.9  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>