246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0496 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  79.8 
 
 		 713 aa  1220    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  91.81 
 
 		 708 aa  1332    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  79.66 
 
 		 713 aa  1174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  79.66 
 
 		 708 aa  1214    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  78.4 
 
 		 713 aa  1197    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  57.06 
 
 		 717 aa  822    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  97.34 
 
 		 713 aa  1394    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  67.56 
 
 		 714 aa  994    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  95.79 
 
 		 713 aa  1400    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  80.08 
 
 		 713 aa  1224    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  63.04 
 
 		 701 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  42.39 
 
 		 716 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  38.09 
 
 		 729 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 769 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 766 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 750 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 744 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 793 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 741 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  35.32 
 
 		 772 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 767 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 780 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 721 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  34.14 
 
 		 775 aa  360  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 718 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 685 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 749 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 705 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 705 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 681 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 698 aa  127  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.8 
 
 		 695 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  24.42 
 
 		 698 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  24.28 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  23.96 
 
 		 668 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23.8 
 
 		 719 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.08 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.65 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 768 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  23.82 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  22.97 
 
 		 687 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 696 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 668 aa  99  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  24.44 
 
 		 686 aa  92.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 706 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.7 
 
 		 688 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  21.8 
 
 		 676 aa  87.8  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  22.45 
 
 		 661 aa  87.8  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  21.65 
 
 		 676 aa  85.1  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 702 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 699 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  21.41 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.52 
 
 		 699 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 685 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.88 
 
 		 726 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.79 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 702 aa  77.8  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.98 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  20.25 
 
 		 687 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 685 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 673 aa  72.4  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 672 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  20.72 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.84 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 661 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  20.9 
 
 		 710 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.2 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.98 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.21 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  23.46 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  21.04 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.75 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  27.37 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  26.64 
 
 		 712 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.07 
 
 		 625 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  19.76 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  24.92 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  26.69 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  21.43 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  26.69 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  35.42 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  34.74 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>