133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0965 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1602    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 769 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 766 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  39.92 
 
 		 750 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  39.59 
 
 		 744 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 729 aa  537  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 758 aa  532  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  38.73 
 
 		 793 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  37.58 
 
 		 772 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 741 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  37.36 
 
 		 775 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 767 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 716 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 780 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  40.97 
 
 		 721 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 766 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 708 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 713 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 713 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  35.07 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 713 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  34.79 
 
 		 708 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 713 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 714 aa  360  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 718 aa  172  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 749 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 705 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 705 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.08 
 
 		 688 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 697 aa  86.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  24.08 
 
 		 687 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  21.8 
 
 		 688 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  21.27 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  20.97 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  19.97 
 
 		 668 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  21.29 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  21.05 
 
 		 749 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.85 
 
 		 719 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  21.33 
 
 		 753 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.07 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 760 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  21.83 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.72 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  24.2 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.72 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.72 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  20.67 
 
 		 745 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  20.48 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  20.48 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  20.48 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  19.76 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  20.62 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  20.35 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.67 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  26.01 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  24.43 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.27 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  21.29 
 
 		 710 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.2 
 
 		 713 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  35.71 
 
 		 686 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.48 
 
 		 699 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 699 aa  55.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 661 aa  55.1  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  28.89 
 
 		 710 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.58 
 
 		 695 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  31.19 
 
 		 667 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.99 
 
 		 661 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 702 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  30.77 
 
 		 663 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  20.05 
 
 		 726 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.28 
 
 		 271 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.28 
 
 		 271 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 804 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 		 702 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.12 
 
 		 681 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 623 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  29.47 
 
 		 668 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  25.67 
 
 		 681 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  30.21 
 
 		 662 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 776 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.29 
 
 		 613 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  25.67 
 
 		 686 aa  49.3  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  28.42 
 
 		 668 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  28.87 
 
 		 691 aa  48.5  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 638 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  20.08 
 
 		 678 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 659 aa  48.5  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>