116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0763 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 721 aa  1474    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  47.12 
 
 		 741 aa  628  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  42.43 
 
 		 758 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  43.39 
 
 		 766 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  41.62 
 
 		 744 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  44.36 
 
 		 769 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 		 729 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  42.15 
 
 		 716 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  41.79 
 
 		 780 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  40.14 
 
 		 793 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 773 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  41.34 
 
 		 767 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 750 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 766 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  39.39 
 
 		 772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  38.18 
 
 		 775 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 713 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 717 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 708 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 713 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 713 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  37.2 
 
 		 708 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 713 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 713 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 713 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  35.9 
 
 		 701 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 718 aa  190  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 749 aa  161  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 705 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 705 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 685 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  24.96 
 
 		 710 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  24.96 
 
 		 710 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  24.96 
 
 		 710 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  24.64 
 
 		 709 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 697 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  24.49 
 
 		 687 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.11 
 
 		 713 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  26.09 
 
 		 698 aa  98.2  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 768 aa  98.2  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  23.76 
 
 		 687 aa  97.8  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  24.63 
 
 		 688 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  26.13 
 
 		 725 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.31 
 
 		 688 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  24.24 
 
 		 749 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  24.24 
 
 		 749 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  24.04 
 
 		 688 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  24.7 
 
 		 688 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 673 aa  94  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  24.13 
 
 		 745 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.06 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  24.06 
 
 		 745 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  23.3 
 
 		 667 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  24.06 
 
 		 745 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  24.06 
 
 		 745 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  28.92 
 
 		 710 aa  90.5  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 681 aa  90.5  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.96 
 
 		 753 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  28.21 
 
 		 691 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 698 aa  87.8  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.23 
 
 		 719 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 668 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 760 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.62 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  22.98 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  29.23 
 
 		 669 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  27.62 
 
 		 724 aa  74.7  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.84 
 
 		 684 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.99 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  25 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 702 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27.61 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  27.38 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  20.99 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  28.04 
 
 		 726 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.7 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  22.65 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  27.66 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  35.87 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  21.88 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  26.29 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  27.3 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  24.5 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.51 
 
 		 668 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 668 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.92 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 763 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 668 aa  52  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  19.56 
 
 		 684 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  21.27 
 
 		 680 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.99 
 
 		 734 aa  48.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.88 
 
 		 698 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>