156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3233 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  62.46 
 
 		 708 aa  880    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  63.83 
 
 		 713 aa  893    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  51.35 
 
 		 717 aa  740    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  63.47 
 
 		 713 aa  881    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  63.04 
 
 		 713 aa  880    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  60.27 
 
 		 714 aa  844    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  62.89 
 
 		 713 aa  894    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 701 aa  1438    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  64.07 
 
 		 708 aa  931    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  63.92 
 
 		 713 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  61.95 
 
 		 713 aa  912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  63.92 
 
 		 713 aa  929    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  39.72 
 
 		 716 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 766 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 769 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 773 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 793 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 741 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 744 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 758 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 721 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 750 aa  357  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 766 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 780 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  31.8 
 
 		 775 aa  336  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 767 aa  331  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  30.5 
 
 		 772 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 749 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 685 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 718 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 705 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 697 aa  119  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  26.31 
 
 		 719 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  25.96 
 
 		 723 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 681 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 698 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 768 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.36 
 
 		 676 aa  93.6  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  23.61 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.21 
 
 		 676 aa  91.3  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  22.17 
 
 		 695 aa  90.9  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  25.04 
 
 		 698 aa  90.5  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 702 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  22.54 
 
 		 687 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 668 aa  87.4  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  24.93 
 
 		 725 aa  87  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 702 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.48 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  23.33 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  23.16 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.28 
 
 		 686 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  23.57 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 661 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 699 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  21.99 
 
 		 687 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  23.59 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  23.57 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  22.36 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.26 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.7 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.7 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.7 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 692 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  21.73 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  21.73 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  21.55 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  21.55 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  21.55 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  21.55 
 
 		 745 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  20.82 
 
 		 713 aa  72  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  21.93 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.03 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 685 aa  68.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 673 aa  67.8  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 685 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 724 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  21.94 
 
 		 667 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  27.54 
 
 		 668 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  26.95 
 
 		 668 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  27.72 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.57 
 
 		 699 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  20.11 
 
 		 696 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.14 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 727 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>