268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  62.48 
 
 
688 aa  883    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  62.77 
 
 
688 aa  883    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  55.74 
 
 
698 aa  698    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  52.2 
 
 
676 aa  727    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  52.43 
 
 
681 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  54.32 
 
 
745 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  54.61 
 
 
749 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  54.61 
 
 
745 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  59.78 
 
 
710 aa  868    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  54.32 
 
 
745 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  55.89 
 
 
725 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  53.47 
 
 
710 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  55.31 
 
 
753 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  52.57 
 
 
681 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  52.29 
 
 
686 aa  725    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  54.46 
 
 
749 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  62.34 
 
 
688 aa  878    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  54.06 
 
 
687 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  54.02 
 
 
687 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  54.26 
 
 
724 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  52.05 
 
 
676 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  53.5 
 
 
710 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  62.62 
 
 
688 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  54.06 
 
 
709 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  53.5 
 
 
710 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  63.2 
 
 
719 aa  898    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  63.06 
 
 
723 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  52.71 
 
 
669 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  53.5 
 
 
710 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  100 
 
 
726 aa  1476    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  53.71 
 
 
713 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  54.52 
 
 
684 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  54.32 
 
 
745 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  46.14 
 
 
691 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  44.72 
 
 
686 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.43 
 
 
661 aa  458  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.03 
 
 
662 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  39.31 
 
 
667 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 
668 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.85 
 
 
668 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  37.56 
 
 
668 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.13 
 
 
667 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.97 
 
 
663 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.19 
 
 
695 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 
672 aa  306  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.08 
 
 
665 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
697 aa  233  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 
699 aa  221  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
681 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  26.23 
 
 
699 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
668 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
702 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
702 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
702 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 
661 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
760 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
768 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
698 aa  129  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 
718 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 
673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 
696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
684 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
685 aa  99  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
685 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 
716 aa  94  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.44 
 
 
701 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 
793 aa  92.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
713 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 
713 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.54 
 
 
625 aa  84.7  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 
714 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
705 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.38 
 
 
750 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.44 
 
 
708 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.73 
 
 
867 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.1 
 
 
689 aa  78.2  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 
744 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21 
 
 
708 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.03 
 
 
780 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 
713 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 
766 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 
713 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  20.55 
 
 
713 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  30.09 
 
 
764 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 
713 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  44.59 
 
 
185 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.04 
 
 
862 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
741 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  32.12 
 
 
764 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
767 aa  71.2  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.27 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.15 
 
 
759 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.28 
 
 
862 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
724 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.06 
 
 
861 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  32.14 
 
 
857 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.21 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
766 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  24.1 
 
 
775 aa  67.8  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>