More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3808 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  84.85 
 
 		 745 aa  1189    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  56.93 
 
 		 688 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  50.76 
 
 		 676 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  57.73 
 
 		 688 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  84.85 
 
 		 745 aa  1189    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 687 aa  1395    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  84.85 
 
 		 745 aa  1189    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  53.53 
 
 		 726 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  57.37 
 
 		 688 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  87.16 
 
 		 749 aa  1194    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  56.93 
 
 		 688 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  61.23 
 
 		 710 aa  801    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  92.72 
 
 		 710 aa  1277    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  91.72 
 
 		 710 aa  1285    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  53.8 
 
 		 681 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  87.42 
 
 		 753 aa  1198    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  53.8 
 
 		 686 aa  694    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  84.81 
 
 		 745 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  51.81 
 
 		 684 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  50.61 
 
 		 676 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  57.14 
 
 		 698 aa  730    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  51.1 
 
 		 669 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  63.81 
 
 		 724 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.1 
 
 		 725 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  90.88 
 
 		 713 aa  1278    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  53.64 
 
 		 681 aa  693    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  92.72 
 
 		 710 aa  1277    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  62.42 
 
 		 719 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  57.01 
 
 		 687 aa  745    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  99.27 
 
 		 709 aa  1387    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  62.42 
 
 		 723 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  92.72 
 
 		 710 aa  1277    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  87.16 
 
 		 749 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.44 
 
 		 691 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  47.24 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.23 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.88 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.79 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.1 
 
 		 667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.55 
 
 		 663 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 668 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  36.95 
 
 		 668 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  36.79 
 
 		 668 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.33 
 
 		 695 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 672 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 		 665 aa  243  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 699 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 697 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 668 aa  184  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.15 
 
 		 699 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 702 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 768 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 702 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 681 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 702 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 760 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 673 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 661 aa  138  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 698 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 716 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 780 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 696 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 721 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 718 aa  101  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 683 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 741 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 775 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 684 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 767 aa  92.8  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 692 aa  90.9  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 729 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 713 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 769 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 693 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 719 aa  84.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 713 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.07 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.58 
 
 		 625 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 725 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.19 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 751 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 698 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 698 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  20.98 
 
 		 712 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.27 
 
 		 685 aa  78.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>