210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0619 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 673 aa  1367    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  33.38 
 
 		 699 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 696 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 702 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 702 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 702 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 668 aa  326  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 684 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 672 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 760 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 681 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 749 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 749 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.99 
 
 		 724 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.48 
 
 		 745 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23.74 
 
 		 719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.9 
 
 		 687 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.39 
 
 		 753 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  22.9 
 
 		 713 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.19 
 
 		 695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.27 
 
 		 723 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  22.61 
 
 		 709 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.75 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.75 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.75 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.6 
 
 		 710 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  22.92 
 
 		 698 aa  123  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.29 
 
 		 684 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 		 725 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  23.65 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  23.65 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  23.49 
 
 		 686 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 793 aa  117  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 		 688 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.62 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.46 
 
 		 726 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 699 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  22.1 
 
 		 688 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  22.46 
 
 		 688 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  23.28 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.46 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  21.36 
 
 		 688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 718 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  21.96 
 
 		 687 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.83 
 
 		 710 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  23.95 
 
 		 661 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  20.06 
 
 		 667 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 767 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  22.94 
 
 		 667 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  22.43 
 
 		 668 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 780 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  22.43 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  22.41 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  21.09 
 
 		 691 aa  101  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 668 aa  99.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 749 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 685 aa  94.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  20.54 
 
 		 669 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 716 aa  93.2  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 768 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 713 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 705 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  20.96 
 
 		 741 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 713 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  22.31 
 
 		 663 aa  87.8  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  21.01 
 
 		 721 aa  86.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 750 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.3 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 766 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  20.38 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 677 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 698 aa  74.7  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 742 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.21 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 677 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 769 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  20.77 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.03 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  22.85 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  24.82 
 
 		 772 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.57 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  21.02 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  24.64 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.5 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.67 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.35 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>