More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3750 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 741 aa  1510    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  47.12 
 
 		 721 aa  622  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  43.62 
 
 		 769 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 766 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 758 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 773 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 750 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 729 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 716 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  40.7 
 
 		 766 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  41.32 
 
 		 793 aa  519  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  39.48 
 
 		 744 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  40.32 
 
 		 780 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  38.92 
 
 		 772 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 767 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  35.57 
 
 		 775 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  40.06 
 
 		 713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 713 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 708 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  39.79 
 
 		 708 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 713 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  38.87 
 
 		 713 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 713 aa  429  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 717 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 714 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  37.39 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 718 aa  193  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 749 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 681 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 685 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 768 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 705 aa  127  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 697 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 760 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 698 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  25.55 
 
 		 698 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  25.71 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  23.37 
 
 		 687 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 672 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  24.47 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  23.09 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.93 
 
 		 719 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 668 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 		 673 aa  95.9  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  24.46 
 
 		 723 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.67 
 
 		 710 aa  94.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  24.1 
 
 		 687 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  22.09 
 
 		 699 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  23.52 
 
 		 713 aa  93.2  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  23.85 
 
 		 688 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  23.38 
 
 		 676 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.05 
 
 		 724 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 694 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  23.6 
 
 		 688 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.23 
 
 		 688 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  23.23 
 
 		 676 aa  87.4  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  23.78 
 
 		 688 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.14 
 
 		 753 aa  87.4  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.48 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  21.71 
 
 		 749 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  21.57 
 
 		 745 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  21.57 
 
 		 749 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 685 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  29.11 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  21.4 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  21.4 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  21.4 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  28.24 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 682 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  28.4 
 
 		 684 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  25.17 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  22.75 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  28.82 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  26.92 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  26.92 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  28.04 
 
 		 710 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  32.21 
 
 		 623 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 668 aa  63.9  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  27.96 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  28.49 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  30.43 
 
 		 667 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>