More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3914 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  56.85 
 
 		 688 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  56.33 
 
 		 725 aa  722    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  50.45 
 
 		 676 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  80.19 
 
 		 745 aa  1180    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  56.37 
 
 		 698 aa  724    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  78.91 
 
 		 749 aa  1187    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  59.69 
 
 		 710 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  51.68 
 
 		 681 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  93.24 
 
 		 710 aa  1323    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  50.3 
 
 		 676 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  51.91 
 
 		 684 aa  720    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  87.52 
 
 		 713 aa  1269    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  79.59 
 
 		 753 aa  1183    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  57 
 
 		 688 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 710 aa  1443    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  57.58 
 
 		 688 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  60.29 
 
 		 719 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  80.33 
 
 		 745 aa  1184    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  63.68 
 
 		 724 aa  908    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  80.3 
 
 		 749 aa  1186    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  51.53 
 
 		 681 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 710 aa  1443    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  80.19 
 
 		 745 aa  1180    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  91.57 
 
 		 687 aa  1281    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  57.43 
 
 		 688 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 710 aa  1443    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  51.02 
 
 		 669 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  55.59 
 
 		 687 aa  745    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  80.19 
 
 		 745 aa  1180    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  90.42 
 
 		 709 aa  1299    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  51.52 
 
 		 686 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  60.58 
 
 		 723 aa  817    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  52.72 
 
 		 726 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.86 
 
 		 691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  44.75 
 
 		 686 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.68 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.46 
 
 		 662 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 		 667 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  37.59 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  35.99 
 
 		 663 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  34.97 
 
 		 668 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 668 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  35.81 
 
 		 668 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.82 
 
 		 695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 672 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 		 665 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 699 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 697 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 668 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 768 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 702 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.11 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 702 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 702 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 760 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 673 aa  138  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 661 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 698 aa  124  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 793 aa  123  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 716 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 780 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 683 aa  105  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 721 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 718 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 741 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 696 aa  94.4  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.85 
 
 		 775 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 767 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 684 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.71 
 
 		 775 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 769 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 713 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 744 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 685 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.53 
 
 		 708 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 719 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  26.5 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.7 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 750 aa  76.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  47.3 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 713 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 682 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 698 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>