193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0534 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  81.5 
 
 		 708 aa  1210    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  98.59 
 
 		 708 aa  1442    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1471    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  57.34 
 
 		 717 aa  833    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  80.65 
 
 		 713 aa  1180    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  79.66 
 
 		 713 aa  1170    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  67.82 
 
 		 714 aa  991    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  79.1 
 
 		 713 aa  1186    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  63.92 
 
 		 701 aa  901    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  98.46 
 
 		 713 aa  1451    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  98.32 
 
 		 713 aa  1449    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  92.57 
 
 		 713 aa  1381    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  43.79 
 
 		 716 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 769 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  38.77 
 
 		 766 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 741 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 729 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 793 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 744 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 766 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 750 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 780 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 758 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 721 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  34.55 
 
 		 772 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 767 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  32.53 
 
 		 775 aa  364  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 718 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 685 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 705 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 681 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 705 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 698 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 697 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.29 
 
 		 662 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.22 
 
 		 719 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  22.07 
 
 		 695 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.78 
 
 		 723 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  23.14 
 
 		 668 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  22.82 
 
 		 668 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  22.76 
 
 		 687 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 668 aa  94  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  23.33 
 
 		 698 aa  91.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 696 aa  90.9  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.93 
 
 		 667 aa  90.5  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 702 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 768 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.19 
 
 		 725 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 699 aa  89  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  21.68 
 
 		 687 aa  87.4  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  23.82 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  23.82 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  23.82 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  21.39 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  21.63 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.87 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.87 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.87 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  21.81 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  21.23 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  21.2 
 
 		 709 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  25.77 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  20.51 
 
 		 749 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  20.51 
 
 		 749 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  20.35 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  20.35 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  20.35 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  20.35 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.29 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 661 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.03 
 
 		 710 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  19.87 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.16 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  20.19 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  20.95 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  27.91 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  30.34 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.59 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  21.24 
 
 		 669 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.98 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 685 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.81 
 
 		 687 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25 
 
 		 728 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 673 aa  63.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.51 
 
 		 862 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  20.26 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.51 
 
 		 862 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.45 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>