More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3292 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  53.53 
 
 		 726 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  80.75 
 
 		 745 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  56.57 
 
 		 688 aa  786    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  80.75 
 
 		 745 aa  1186    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  51.57 
 
 		 684 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  50.45 
 
 		 676 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  80.75 
 
 		 745 aa  1186    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  58.21 
 
 		 688 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  79.44 
 
 		 749 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  60.92 
 
 		 710 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  57 
 
 		 688 aa  792    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  90 
 
 		 710 aa  1291    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  90.85 
 
 		 710 aa  1309    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  50.3 
 
 		 676 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  50.43 
 
 		 681 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  79.02 
 
 		 753 aa  1197    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  56.57 
 
 		 688 aa  782    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  89.62 
 
 		 713 aa  1293    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  87.16 
 
 		 749 aa  1192    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  62.61 
 
 		 724 aa  905    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  54.72 
 
 		 725 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  90 
 
 		 710 aa  1291    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  50.5 
 
 		 686 aa  699    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  51.25 
 
 		 669 aa  676    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  54.87 
 
 		 698 aa  729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  62.27 
 
 		 719 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  50.57 
 
 		 681 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 709 aa  1442    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  80.75 
 
 		 745 aa  1186    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  62.27 
 
 		 723 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  99.27 
 
 		 687 aa  1387    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  56.72 
 
 		 687 aa  741    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  90 
 
 		 710 aa  1291    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.01 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  47.24 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.8 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.73 
 
 		 662 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.79 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.25 
 
 		 667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 668 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.69 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.1 
 
 		 668 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  36.95 
 
 		 668 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.87 
 
 		 695 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 672 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.99 
 
 		 665 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 699 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 697 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.85 
 
 		 699 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 768 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 702 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 702 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 681 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 702 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 760 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 661 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 698 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 716 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 780 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 721 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 775 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 718 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 683 aa  97.8  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 684 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 741 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 767 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 692 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 744 aa  87.4  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 705 aa  85.1  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 677 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 719 aa  84.7  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 769 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.1 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.04 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 725 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 742 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 751 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.4 
 
 		 625 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 724 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 751 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 698 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.02 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.27 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>