197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2981 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  69.72 
 
 
684 aa  975    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  58.69 
 
 
688 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  53.39 
 
 
676 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  64.3 
 
 
686 aa  900    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  52.94 
 
 
745 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  63.99 
 
 
681 aa  898    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
669 aa  1379    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  53.1 
 
 
749 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  57.74 
 
 
710 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  54.02 
 
 
710 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  53.18 
 
 
753 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  58.1 
 
 
688 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  52.87 
 
 
687 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  49.28 
 
 
724 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 
710 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  58.22 
 
 
719 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 
710 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  63.99 
 
 
681 aa  898    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  53.02 
 
 
709 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  58.22 
 
 
723 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  53.64 
 
 
710 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  53.22 
 
 
698 aa  682    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  58.69 
 
 
688 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  53.07 
 
 
725 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  51.67 
 
 
687 aa  709    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  52.87 
 
 
713 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  52.94 
 
 
745 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  53.1 
 
 
745 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  53.1 
 
 
749 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  52.94 
 
 
745 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  54.04 
 
 
726 aa  725    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  56.75 
 
 
688 aa  800    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  53.23 
 
 
676 aa  694    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.96 
 
 
691 aa  588  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  41.02 
 
 
686 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.16 
 
 
667 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  38.78 
 
 
661 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  35.86 
 
 
662 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.36 
 
 
667 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.32 
 
 
668 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 
668 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  37.17 
 
 
668 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.19 
 
 
663 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 
672 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.71 
 
 
695 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
665 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
699 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
697 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 
681 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
760 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
768 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
668 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
702 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
661 aa  127  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.85 
 
 
699 aa  122  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 
718 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
702 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
741 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 
793 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
685 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 
673 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 
750 aa  90.9  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 
705 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
716 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 
775 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
696 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 
767 aa  82  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
684 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 
713 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  20.74 
 
 
714 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 
729 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
683 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 
708 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
721 aa  75.1  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
766 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 
713 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  20.41 
 
 
713 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
698 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 
780 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  51.56 
 
 
185 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 
713 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  24.9 
 
 
775 aa  71.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
725 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 
751 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
681 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
751 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
698 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
681 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 
769 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 
713 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.46 
 
 
708 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 
706 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.52 
 
 
625 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
724 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
692 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 
677 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>