More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2174 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  56.1 
 
 
688 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  81.27 
 
 
749 aa  1202    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  56.33 
 
 
698 aa  725    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  52.3 
 
 
676 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  81.16 
 
 
745 aa  1196    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  91.72 
 
 
687 aa  1284    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  81.16 
 
 
745 aa  1196    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  81.16 
 
 
745 aa  1196    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  80.24 
 
 
749 aa  1202    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  51.45 
 
 
669 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  56.17 
 
 
725 aa  723    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  81.58 
 
 
745 aa  1202    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  60.09 
 
 
710 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
710 aa  1450    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  56.24 
 
 
688 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  87.86 
 
 
753 aa  1201    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  51.78 
 
 
684 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  55.81 
 
 
688 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  56.96 
 
 
688 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  51.67 
 
 
676 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  87.1 
 
 
713 aa  1273    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  62.52 
 
 
724 aa  912    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  53.03 
 
 
726 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  51.42 
 
 
686 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  93.24 
 
 
710 aa  1316    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  51.36 
 
 
681 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  55.38 
 
 
687 aa  740    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  93.24 
 
 
710 aa  1316    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  51.51 
 
 
681 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  93.24 
 
 
710 aa  1316    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  90.85 
 
 
709 aa  1308    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  60 
 
 
719 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  60.29 
 
 
723 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.81 
 
 
691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  44.73 
 
 
686 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.48 
 
 
661 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.31 
 
 
662 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  35.92 
 
 
663 aa  392  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  35.96 
 
 
668 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 
667 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 
668 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  35.66 
 
 
668 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.79 
 
 
695 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 
672 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.34 
 
 
665 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
699 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 
697 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
668 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.75 
 
 
699 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
702 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
768 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
702 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
702 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
760 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
673 aa  137  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 
661 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
698 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
793 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
716 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 
780 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22 
 
 
696 aa  98.6  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 
775 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
683 aa  94.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
721 aa  92.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 
741 aa  91.3  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
684 aa  87.4  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
693 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
692 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.79 
 
 
775 aa  79.7  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
681 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
681 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 
705 aa  79  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
742 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
769 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 
751 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.08 
 
 
625 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 
767 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 
719 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
677 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
751 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  25.64 
 
 
772 aa  75.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
677 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 
694 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 
713 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
698 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
698 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 
628 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
744 aa  74.7  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  20.95 
 
 
712 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
698 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
725 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
724 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.15 
 
 
708 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
706 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 
713 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.17 
 
 
685 aa  71.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>