More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4607 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  54.48 
 
 		 688 aa  734    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  55.35 
 
 		 688 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  50.76 
 
 		 676 aa  663    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  54.48 
 
 		 688 aa  737    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  52.58 
 
 		 686 aa  690    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  65.02 
 
 		 745 aa  912    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  54.62 
 
 		 688 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  65.02 
 
 		 745 aa  912    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  65.26 
 
 		 687 aa  900    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  65.76 
 
 		 749 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  49.93 
 
 		 669 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  65.76 
 
 		 749 aa  919    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  53.86 
 
 		 710 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  64.95 
 
 		 710 aa  901    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  65.41 
 
 		 710 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  66.06 
 
 		 753 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  53.97 
 
 		 726 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  49.71 
 
 		 684 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  64.95 
 
 		 710 aa  901    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  50.5 
 
 		 681 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  51.2 
 
 		 725 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 724 aa  1489    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  64.95 
 
 		 710 aa  901    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  65.32 
 
 		 745 aa  917    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  50.64 
 
 		 681 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  50.6 
 
 		 676 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  55.6 
 
 		 719 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  65.45 
 
 		 713 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  53.2 
 
 		 698 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  65.11 
 
 		 709 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  55.18 
 
 		 723 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  65.02 
 
 		 745 aa  912    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  53.82 
 
 		 687 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.04 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  45.52 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  37.68 
 
 		 661 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.14 
 
 		 668 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 668 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.25 
 
 		 662 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  36.17 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.77 
 
 		 663 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  36.99 
 
 		 668 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  36.47 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.08 
 
 		 695 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 672 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 697 aa  250  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 699 aa  243  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 		 665 aa  243  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 668 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 681 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 702 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 702 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 673 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.07 
 
 		 699 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 702 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 661 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 768 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 698 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 760 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 718 aa  124  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 729 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 793 aa  105  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 775 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 685 aa  99  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 685 aa  94.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 684 aa  90.5  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 692 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.99 
 
 		 708 aa  89.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 750 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 741 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 677 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 724 aa  87.8  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 693 aa  87.4  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  20.99 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  20.59 
 
 		 708 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  22.93 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 713 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  22.87 
 
 		 701 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.68 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 725 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.71 
 
 		 625 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 751 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  46.75 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 766 aa  77.4  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 713 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 780 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  22.92 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 719 aa  74.3  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.09 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 682 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 735 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>