265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3668 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 686 aa  1384    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  46.62 
 
 		 723 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  46.03 
 
 		 710 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  46.91 
 
 		 719 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  45.22 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  44.78 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  44.64 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  47.24 
 
 		 687 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  47.24 
 
 		 709 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  44.49 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  47 
 
 		 713 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  45.24 
 
 		 749 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  45.65 
 
 		 753 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  45.09 
 
 		 749 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  45.45 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  45.45 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  45.25 
 
 		 745 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  45.45 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  45.1 
 
 		 745 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  45.35 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  45.1 
 
 		 745 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  45.1 
 
 		 745 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  44.49 
 
 		 726 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  45.52 
 
 		 724 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  43.68 
 
 		 687 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  45.92 
 
 		 698 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  45.84 
 
 		 725 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  42.39 
 
 		 676 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  42.24 
 
 		 676 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  41.02 
 
 		 669 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  38.78 
 
 		 684 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  39.97 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  41.27 
 
 		 681 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  40.97 
 
 		 681 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.68 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  39.94 
 
 		 667 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.06 
 
 		 662 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.88 
 
 		 668 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  38.99 
 
 		 668 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  38.99 
 
 		 668 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  38.12 
 
 		 667 aa  429  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  37.94 
 
 		 663 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  35.92 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.33 
 
 		 695 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.99 
 
 		 665 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 697 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 672 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 699 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 760 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 681 aa  160  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 768 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 702 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.77 
 
 		 699 aa  147  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 702 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 668 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 698 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 683 aa  107  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 673 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 705 aa  101  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 718 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.73 
 
 		 625 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 696 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 714 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.24 
 
 		 708 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 684 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 685 aa  81.6  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.42 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  30.74 
 
 		 687 aa  81.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 716 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.38 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  24.36 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 708 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.22 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.5 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  46.48 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.11 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 668 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  22.84 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 674 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 767 aa  60.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  27.31 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.33 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>