139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03808 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1457    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 749 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 718 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 705 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  26.86 
 
 		 708 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 713 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 793 aa  153  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 717 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 766 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 750 aa  138  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  22.55 
 
 		 772 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  24.67 
 
 		 701 aa  132  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 713 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 780 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 708 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 716 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 713 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 767 aa  124  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 729 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 713 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 681 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 741 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 721 aa  114  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 760 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.84 
 
 		 775 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 713 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 714 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 773 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  25.46 
 
 		 688 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 672 aa  97.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 766 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  24.69 
 
 		 688 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  23.47 
 
 		 687 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.68 
 
 		 688 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  24.79 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  22.66 
 
 		 723 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 768 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 697 aa  89.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 769 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 744 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 661 aa  87.4  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.79 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  24.89 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25.14 
 
 		 687 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  23.89 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  22.99 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 710 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.36 
 
 		 668 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  22.51 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.91 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  22.07 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  22.14 
 
 		 698 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.42 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  22.38 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27.42 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  28.65 
 
 		 686 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  23.36 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  23.1 
 
 		 709 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  27.75 
 
 		 684 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  25.65 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.47 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.47 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.47 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  19.88 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.15 
 
 		 755 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  31.71 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  31.71 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  24.48 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 684 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 702 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 727 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.45 
 
 		 753 aa  55.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  23.94 
 
 		 746 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 746 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  23.94 
 
 		 746 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  24.47 
 
 		 759 aa  54.7  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  54.3  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  22.16 
 
 		 749 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  23.94 
 
 		 746 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  22.16 
 
 		 749 aa  54.3  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  29.52 
 
 		 710 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  34.83 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  22.39 
 
 		 745 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  31.31 
 
 		 713 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.08 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  26.47 
 
 		 662 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  28.57 
 
 		 724 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>