178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2221 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  50.64 
 
 		 750 aa  740    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  50.65 
 
 		 772 aa  744    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  49.43 
 
 		 766 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  52.49 
 
 		 767 aa  783    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  47.18 
 
 		 780 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 793 aa  1644    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  42.31 
 
 		 729 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  43.16 
 
 		 769 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  41.58 
 
 		 766 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 716 aa  512  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 744 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  41.08 
 
 		 741 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  40.16 
 
 		 721 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  37.1 
 
 		 775 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 708 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  38.13 
 
 		 713 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 713 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 713 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 713 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 713 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 713 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  36.06 
 
 		 708 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 713 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 717 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  34.33 
 
 		 701 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 718 aa  193  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 749 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 685 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 705 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 705 aa  127  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  24.6 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  24.6 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  24.6 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  24.6 
 
 		 687 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  24.96 
 
 		 698 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  24.43 
 
 		 709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  24.96 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 687 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.03 
 
 		 713 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 673 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  22.83 
 
 		 699 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  23.54 
 
 		 688 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  24.4 
 
 		 710 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 697 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  22.62 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.76 
 
 		 710 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 661 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.62 
 
 		 724 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.24 
 
 		 723 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.45 
 
 		 749 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.31 
 
 		 749 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  22.24 
 
 		 688 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.18 
 
 		 745 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  22.18 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.4 
 
 		 753 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 672 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.05 
 
 		 745 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.05 
 
 		 745 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.05 
 
 		 745 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 698 aa  100  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 668 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 760 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  22.25 
 
 		 669 aa  94.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 768 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.85 
 
 		 695 aa  92.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.56 
 
 		 726 aa  92.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.76 
 
 		 676 aa  92  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 702 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.62 
 
 		 676 aa  89.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 681 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  29.39 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.82 
 
 		 681 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27.82 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  27.6 
 
 		 686 aa  72  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 744 aa  72  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.87 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  22.38 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 682 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  27.88 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  23.42 
 
 		 691 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.7 
 
 		 859 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  28.86 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  28.86 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 713 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.02 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  27.22 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.65 
 
 		 734 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 682 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.96 
 
 		 661 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  25.96 
 
 		 728 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>