215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0303 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  100 
 
 
681 aa  1399    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.65 
 
 
695 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 
672 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
697 aa  275  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30 
 
 
699 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  29.1 
 
 
723 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  29.24 
 
 
719 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  28.02 
 
 
688 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  28.17 
 
 
688 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  27.74 
 
 
688 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  28.55 
 
 
688 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  28.31 
 
 
710 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  26.71 
 
 
687 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  27.29 
 
 
726 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  26.67 
 
 
676 aa  173  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  27.94 
 
 
725 aa  170  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  26.51 
 
 
676 aa  170  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
668 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  25.47 
 
 
669 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  27.94 
 
 
698 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  27.65 
 
 
713 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.82 
 
 
724 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  27 
 
 
686 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  28.73 
 
 
686 aa  160  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
673 aa  159  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  26.95 
 
 
687 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.16 
 
 
681 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  27.47 
 
 
668 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27 
 
 
681 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  25.67 
 
 
745 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  27.31 
 
 
668 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  26.8 
 
 
709 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  25.67 
 
 
745 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  25.67 
 
 
745 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  24.59 
 
 
691 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  25.35 
 
 
745 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
768 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  25.2 
 
 
749 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  25.2 
 
 
749 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
718 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  26.35 
 
 
710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  25.2 
 
 
753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  26.43 
 
 
710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  26.43 
 
 
710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  26.43 
 
 
710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.92 
 
 
662 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.83 
 
 
699 aa  144  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  26.24 
 
 
667 aa  143  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.89 
 
 
684 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.88 
 
 
667 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
741 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  24.8 
 
 
661 aa  137  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
702 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
708 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
713 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  24.42 
 
 
663 aa  134  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
713 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  25.14 
 
 
708 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
702 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
714 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 
696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
766 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
713 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
702 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
713 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 
713 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
713 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
698 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 
717 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 
668 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
716 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
767 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
750 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  24.03 
 
 
772 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 
749 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
685 aa  100  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  22.93 
 
 
701 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
766 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 
780 aa  93.2  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
793 aa  92  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
685 aa  88.2  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
758 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
721 aa  80.9  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 
744 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.85 
 
 
867 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
769 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.71 
 
 
665 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.79 
 
 
775 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 
759 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
683 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
730 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25.28 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.73 
 
 
625 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25 
 
 
862 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>