57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0435 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 		 596 aa  1210    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.65 
 
 		 625 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 699 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  25.33 
 
 		 695 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 672 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  30.41 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  30.11 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  25.96 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  28.4 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  27.84 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  31.29 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  28.4 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  27.5 
 
 		 686 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.81 
 
 		 713 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  26.2 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  24.19 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  26.2 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  26.2 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  25.3 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  30.67 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  31.91 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  31.91 
 
 		 725 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  23.28 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  28.48 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  27.88 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  27.88 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  26.95 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  22.66 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  27.27 
 
 		 688 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  25.14 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  27.81 
 
 		 676 aa  63.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  27.81 
 
 		 676 aa  63.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  27.27 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  25.13 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  25.13 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  25.13 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.68 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  27.27 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  27.27 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.68 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  27.27 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  24.61 
 
 		 745 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  27.16 
 
 		 669 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  28.22 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  29.17 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  29.68 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 768 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 697 aa  51.6  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 668 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  27.23 
 
 		 699 aa  50.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 760 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.81 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 714 aa  43.9  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>