More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0287 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  99.71 
 
 
698 aa  1353    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  55.74 
 
 
680 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  99.85 
 
 
698 aa  1355    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  55.04 
 
 
727 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  76.81 
 
 
724 aa  1033    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  99.71 
 
 
751 aa  1356    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  100 
 
 
681 aa  1358    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  76.95 
 
 
692 aa  1082    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  76.84 
 
 
677 aa  1066    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  55.75 
 
 
682 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  94.04 
 
 
725 aa  1224    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  76.36 
 
 
694 aa  1060    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  54.29 
 
 
719 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  76.21 
 
 
742 aa  1062    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  55.81 
 
 
681 aa  717    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  55.77 
 
 
685 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  78.71 
 
 
693 aa  1066    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  56.91 
 
 
687 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  76.25 
 
 
677 aa  1057    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  99.71 
 
 
698 aa  1355    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  99.85 
 
 
751 aa  1357    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  57.06 
 
 
687 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  100 
 
 
681 aa  1358    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 
694 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  46.64 
 
 
685 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  42.82 
 
 
727 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  44.68 
 
 
702 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  44.87 
 
 
713 aa  492  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 
702 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 
706 aa  353  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 
744 aa  350  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  34.76 
 
 
758 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 
758 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  34.76 
 
 
758 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  34.61 
 
 
758 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.95 
 
 
758 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
689 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 
705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
681 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 
734 aa  313  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.14 
 
 
681 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 
707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 
714 aa  308  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.81 
 
 
801 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 
676 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 
709 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 
705 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
695 aa  302  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
685 aa  302  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
682 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
835 aa  300  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 
693 aa  300  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 
730 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
699 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
821 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 
751 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 
723 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 
731 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 
695 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
702 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.37 
 
 
709 aa  272  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.41 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 
719 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 
719 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 
714 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 
744 aa  260  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 
708 aa  254  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
709 aa  253  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
784 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.39 
 
 
778 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 
784 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
797 aa  250  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.51 
 
 
774 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  30.49 
 
 
782 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 
783 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
789 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
799 aa  237  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 
766 aa  164  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
759 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25 
 
 
763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
735 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  25.53 
 
 
868 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  40.61 
 
 
249 aa  124  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 
732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 
836 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.93 
 
 
859 aa  104  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 
824 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.84 
 
 
753 aa  94  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.89 
 
 
857 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.85 
 
 
749 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.85 
 
 
749 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.85 
 
 
745 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.77 
 
 
745 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.77 
 
 
745 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 
698 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.77 
 
 
745 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.09 
 
 
762 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 
730 aa  84.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>