More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1894 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  49.09 
 
 		 699 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  52.28 
 
 		 709 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 709 aa  1417    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 685 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 708 aa  342  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 682 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 685 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 727 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 706 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 734 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 719 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 689 aa  317  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 821 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.45 
 
 		 687 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.59 
 
 		 687 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 694 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 758 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 689 aa  298  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  32.63 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 682 aa  293  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  32.72 
 
 		 758 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 693 aa  293  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.4 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  32.2 
 
 		 758 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.52 
 
 		 801 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 695 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 835 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 744 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 681 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  33.19 
 
 		 685 aa  277  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 751 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.65 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 677 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 692 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  30.25 
 
 		 681 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 694 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 742 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 693 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 677 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 724 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 702 aa  263  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 702 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 727 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 751 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 681 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 698 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 681 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 698 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.41 
 
 		 778 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 719 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 719 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 731 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 707 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 723 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 714 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 797 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 713 aa  243  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  28.4 
 
 		 774 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.6 
 
 		 782 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 784 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 784 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.53 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 799 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 733 aa  196  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 702 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  21.51 
 
 		 868 aa  158  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 766 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 763 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 776 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 836 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 735 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 780 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 776 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 824 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  41.1 
 
 		 249 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 818 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 797 aa  94.4  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  22.95 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  20.1 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  21.45 
 
 		 776 aa  77.4  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.64 
 
 		 690 aa  77  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>