195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0130 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  99.62 
 
 
783 aa  1617    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  51.28 
 
 
892 aa  808    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  45.7 
 
 
891 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  51.02 
 
 
892 aa  808    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  99.16 
 
 
830 aa  1703    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  45.25 
 
 
885 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  100 
 
 
830 aa  1719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.83 
 
 
734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.48 
 
 
717 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.35 
 
 
743 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.69 
 
 
722 aa  181  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.88 
 
 
779 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.23 
 
 
778 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  25.68 
 
 
778 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.01 
 
 
669 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
685 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.53 
 
 
1186 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
973 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
747 aa  140  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  23.19 
 
 
753 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.51 
 
 
676 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.5 
 
 
660 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.29 
 
 
661 aa  137  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.5 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.69 
 
 
696 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
694 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.45 
 
 
696 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.32 
 
 
696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.91 
 
 
696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.18 
 
 
695 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.6 
 
 
688 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.39 
 
 
696 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  25.08 
 
 
676 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.84 
 
 
676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  24.84 
 
 
676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.88 
 
 
690 aa  119  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  22.2 
 
 
697 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.28 
 
 
681 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  39.58 
 
 
783 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 
704 aa  107  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  23.05 
 
 
784 aa  107  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  27.32 
 
 
757 aa  106  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.62 
 
 
859 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.2 
 
 
694 aa  96.3  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.86 
 
 
862 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.86 
 
 
759 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
982 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.32 
 
 
857 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.81 
 
 
849 aa  91.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
1054 aa  91.3  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.08 
 
 
862 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.25 
 
 
862 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
1045 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.32 
 
 
764 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.17 
 
 
689 aa  88.2  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 
823 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  25.49 
 
 
930 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.91 
 
 
867 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  22.97 
 
 
764 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  28.76 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
728 aa  84.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  30.26 
 
 
861 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  26.51 
 
 
989 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  25.14 
 
 
755 aa  81.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
1018 aa  79.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 
652 aa  78.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  31.29 
 
 
712 aa  77.8  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.41 
 
 
668 aa  77.8  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  30.68 
 
 
915 aa  76.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21 
 
 
716 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  21.34 
 
 
800 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.32 
 
 
851 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  23.32 
 
 
851 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  31.55 
 
 
693 aa  71.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
791 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 
1040 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 
668 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 
771 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  27.27 
 
 
698 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.48 
 
 
677 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  23.55 
 
 
490 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
693 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.41 
 
 
646 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 
670 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.45 
 
 
657 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 
687 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
649 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 
681 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.61 
 
 
686 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.23 
 
 
744 aa  60.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.38 
 
 
654 aa  59.7  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.38 
 
 
661 aa  58.9  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 
722 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
654 aa  57.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.26 
 
 
655 aa  57.4  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  24.59 
 
 
458 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 
743 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
644 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>