104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0115 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  57.01 
 
 
747 aa  882    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  100 
 
 
753 aa  1552    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  36.66 
 
 
755 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  34.17 
 
 
757 aa  379  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  28.1 
 
 
915 aa  297  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
823 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.1 
 
 
669 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.38 
 
 
885 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.48 
 
 
891 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.19 
 
 
717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.97 
 
 
743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.55 
 
 
685 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.49 
 
 
734 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.34 
 
 
722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.95 
 
 
892 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.95 
 
 
892 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.19 
 
 
783 aa  128  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  23.22 
 
 
830 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  23.19 
 
 
830 aa  126  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.83 
 
 
778 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.42 
 
 
783 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.56 
 
 
779 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  23.67 
 
 
778 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  23.87 
 
 
851 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  24.48 
 
 
851 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.95 
 
 
849 aa  97.4  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
973 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  27.27 
 
 
930 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.55 
 
 
1186 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  25.24 
 
 
989 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  22.28 
 
 
784 aa  72  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 
649 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.12 
 
 
694 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.51 
 
 
704 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
982 aa  67.8  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
657 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  28.5 
 
 
693 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.92 
 
 
712 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.2 
 
 
668 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.98 
 
 
696 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 
728 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
1018 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.25 
 
 
661 aa  58.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.31 
 
 
654 aa  56.6  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.37 
 
 
688 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.85 
 
 
696 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.99 
 
 
677 aa  54.7  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.24 
 
 
696 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.66 
 
 
696 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.26 
 
 
676 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.61 
 
 
689 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  20.36 
 
 
744 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.32 
 
 
695 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.85 
 
 
696 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  35.63 
 
 
660 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  35.63 
 
 
660 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  21.9 
 
 
730 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.67 
 
 
661 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.19 
 
 
769 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.49 
 
 
730 aa  51.6  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.75 
 
 
759 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  32.63 
 
 
676 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  32.63 
 
 
676 aa  51.2  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.63 
 
 
676 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.75 
 
 
769 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.78 
 
 
646 aa  50.8  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  20.84 
 
 
764 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 
668 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.38 
 
 
697 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.61 
 
 
764 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  21.02 
 
 
764 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
1040 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  21.35 
 
 
737 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  29.35 
 
 
992 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 
300 aa  48.9  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
1045 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  23.84 
 
 
673 aa  48.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.37 
 
 
861 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.46 
 
 
718 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 
1054 aa  47.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.46 
 
 
767 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.46 
 
 
767 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.46 
 
 
767 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.26 
 
 
867 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.74 
 
 
862 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.52 
 
 
759 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  25.82 
 
 
644 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 
800 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 
644 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  23.83 
 
 
644 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.52 
 
 
862 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.52 
 
 
862 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.57 
 
 
859 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  21.66 
 
 
755 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  26.43 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.22 
 
 
754 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
698 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.33 
 
 
714 aa  45.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.71 
 
 
857 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0329  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 
800 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>