269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2389 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  100 
 
 
823 aa  1679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  29.75 
 
 
753 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 
747 aa  264  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.02 
 
 
669 aa  233  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  26.54 
 
 
757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  26.42 
 
 
755 aa  204  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.21 
 
 
891 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.5 
 
 
885 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.7 
 
 
892 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.95 
 
 
892 aa  147  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.34 
 
 
722 aa  140  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 
973 aa  134  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  26.22 
 
 
851 aa  131  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.1 
 
 
717 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  26.09 
 
 
851 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  23.45 
 
 
830 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
982 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.26 
 
 
734 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.56 
 
 
1186 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.66 
 
 
743 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.88 
 
 
783 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.62 
 
 
849 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  27.04 
 
 
930 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.12 
 
 
685 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  23.47 
 
 
778 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
1018 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.33 
 
 
778 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.7 
 
 
779 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  38.51 
 
 
915 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.5 
 
 
694 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.89 
 
 
867 aa  101  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  26.17 
 
 
989 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
1040 aa  100  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
654 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.87 
 
 
862 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.47 
 
 
862 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.65 
 
 
861 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  25.3 
 
 
490 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  20.94 
 
 
784 aa  88.2  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
783 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.02 
 
 
862 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.59 
 
 
830 aa  87.4  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  25.59 
 
 
857 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.32 
 
 
859 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 
808 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
817 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 
808 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.65 
 
 
676 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.82 
 
 
681 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
1054 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.93 
 
 
696 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  41.43 
 
 
795 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 
809 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
792 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.4 
 
 
696 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 
798 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.7 
 
 
696 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  28.86 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.68 
 
 
696 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.52 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.79 
 
 
716 aa  72  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
809 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  48.04 
 
 
796 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  28.31 
 
 
809 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.4 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  48.04 
 
 
796 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.48 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
1045 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.32 
 
 
696 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.05 
 
 
690 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  23.95 
 
 
676 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.95 
 
 
676 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
795 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.95 
 
 
676 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.51 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.85 
 
 
694 aa  68.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 
802 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.02 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  46.6 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.85 
 
 
749 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.69 
 
 
833 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.46 
 
 
695 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.98 
 
 
661 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 
821 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 
819 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  43.27 
 
 
812 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.67 
 
 
704 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.49 
 
 
801 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 
789 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.83 
 
 
668 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.28 
 
 
698 aa  66.6  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  42.55 
 
 
822 aa  65.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.93 
 
 
752 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.75 
 
 
677 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  25.91 
 
 
712 aa  64.7  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  42.71 
 
 
518 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  45.74 
 
 
795 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  24.01 
 
 
652 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.61 
 
 
810 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  21.28 
 
 
764 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>