More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0725 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  100 
 
 		 633 aa  1276    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  64.36 
 
 		 821 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  71.28 
 
 		 819 aa  806    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  42.37 
 
 		 829 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  38.64 
 
 		 829 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 		 812 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.14 
 
 		 833 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  40.07 
 
 		 801 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  39.07 
 
 		 808 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  38.34 
 
 		 863 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  37.31 
 
 		 778 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 815 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  39.16 
 
 		 729 aa  346  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 831 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 799 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 		 799 aa  340  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 748 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 769 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 771 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  40.41 
 
 		 771 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 817 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 828 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  39.96 
 
 		 518 aa  328  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 791 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  35.07 
 
 		 791 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  41.02 
 
 		 745 aa  323  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  33.22 
 
 		 799 aa  319  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  37.67 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  40.73 
 
 		 723 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  39.1 
 
 		 733 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 802 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  38.3 
 
 		 701 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 806 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  36.13 
 
 		 747 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 		 714 aa  312  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 794 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.55 
 
 		 797 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  40.12 
 
 		 745 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.42 
 
 		 806 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  36.83 
 
 		 729 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  36.83 
 
 		 729 aa  306  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.39 
 
 		 810 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  36.13 
 
 		 747 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 719 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  36.63 
 
 		 729 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 747 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 828 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  38.12 
 
 		 703 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  38.12 
 
 		 703 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  36.23 
 
 		 745 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 808 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 810 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  35.34 
 
 		 752 aa  300  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 794 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 828 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 810 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.44 
 
 		 828 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 822 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  34.26 
 
 		 747 aa  294  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  39.58 
 
 		 744 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 728 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  40.12 
 
 		 717 aa  293  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 		 744 aa  293  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 820 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  36.62 
 
 		 724 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 735 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 728 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  39.92 
 
 		 717 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  37.43 
 
 		 740 aa  290  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  38.23 
 
 		 789 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 797 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  39.27 
 
 		 737 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 747 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 747 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 779 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 877 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 717 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 754 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 		 721 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 		 784 aa  278  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 757 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 		 665 aa  275  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 785 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 785 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 784 aa  273  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 736 aa  273  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 785 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 740 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  37.52 
 
 		 728 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 750 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 745 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 741 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  38.94 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 736 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>