More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3699 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 		 1186 aa  2419    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  34.18 
 
 		 989 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  33.73 
 
 		 930 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 728 aa  235  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1040 aa  235  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 973 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 1018 aa  232  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  27.03 
 
 		 891 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 982 aa  228  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.31 
 
 		 885 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1054 aa  212  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1045 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  25.09 
 
 		 784 aa  197  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.6 
 
 		 892 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26 
 
 		 779 aa  158  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.4 
 
 		 892 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.42 
 
 		 830 aa  142  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.32 
 
 		 830 aa  139  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.39 
 
 		 783 aa  132  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  33.56 
 
 		 861 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 823 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  32.38 
 
 		 857 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30 
 
 		 859 aa  108  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.89 
 
 		 862 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.89 
 
 		 862 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  41.18 
 
 		 778 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.38 
 
 		 862 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.34 
 
 		 669 aa  99.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.95 
 
 		 849 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.44 
 
 		 783 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.28 
 
 		 867 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.61 
 
 		 685 aa  95.5  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.13 
 
 		 261 aa  95.5  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  26.15 
 
 		 240 aa  94.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.41 
 
 		 722 aa  93.2  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  25.77 
 
 		 240 aa  92.8  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  34.39 
 
 		 778 aa  93.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 		 809 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.11 
 
 		 717 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 833 aa  89.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  31.6 
 
 		 851 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.53 
 
 		 734 aa  87.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  31.2 
 
 		 851 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  36.36 
 
 		 809 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.03 
 
 		 693 aa  86.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 807 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  41.79 
 
 		 836 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 809 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.67 
 
 		 817 aa  82.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 819 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.28 
 
 		 743 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.76 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  30.81 
 
 		 757 aa  77.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  27.27 
 
 		 258 aa  77.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  29.17 
 
 		 255 aa  77.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 778 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  27.8 
 
 		 633 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  44.54 
 
 		 812 aa  77  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  26.29 
 
 		 250 aa  77  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.05 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 753 aa  75.1  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.51 
 
 		 232 aa  74.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 518 aa  73.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  28.91 
 
 		 680 aa  73.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 756 aa  73.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 829 aa  73.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  27.46 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  31 
 
 		 789 aa  72.4  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.85 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.87 
 
 		 815 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.03 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  29.39 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 815 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  33.71 
 
 		 771 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  47.5 
 
 		 839 aa  71.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.31 
 
 		 812 aa  71.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30.23 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 863 aa  70.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 844 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  28.06 
 
 		 225 aa  69.3  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  28.42 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.55 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  28.57 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  26.33 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  28.85 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  28.79 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.56 
 
 		 661 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  38.85 
 
 		 712 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.7 
 
 		 207 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  25.12 
 
 		 645 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>