179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0475 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0475  porin  100 
 
 		 283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  41.22 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  44.44 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  37.5 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  42.36 
 
 		 248 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  36.23 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  34.95 
 
 		 240 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  34.62 
 
 		 240 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  38.55 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  33 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  34.22 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  34.22 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.17 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  32.28 
 
 		 228 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  31.58 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  31.58 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  32.82 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.72 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  34.39 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  31.93 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  32.38 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  33.33 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  36.29 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.4 
 
 		 207 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  34.31 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.73 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  32.06 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.47 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  33.21 
 
 		 997 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.44 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  31.45 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  31.12 
 
 		 228 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  32.17 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.63 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  32.1 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  31.1 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.06 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.78 
 
 		 207 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  33.58 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  31.54 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  34.59 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  27.82 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  30.69 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  29.03 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  35.04 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  32.1 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  31.62 
 
 		 453 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.11 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  32.75 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.83 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  31.12 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  31.03 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.83 
 
 		 661 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  31.6 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  28.7 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  32.41 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  30.8 
 
 		 652 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.6 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  31.54 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  28.74 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  29.41 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.21 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.9 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  25 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  31.76 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  30.56 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  29.07 
 
 		 689 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  29.32 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  33.79 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  31.01 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  30.93 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  28.28 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  29.32 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  30.8 
 
 		 571 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  28.06 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.72 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  30.6 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  32.99 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  27.04 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  31.78 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  31.78 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  30.71 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  30.74 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.44 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  31.37 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  31.03 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  28.91 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  31.37 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  31.82 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  30.18 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  30.82 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  31.68 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  30.82 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  31.74 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  31.4 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  31.03 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  31.03 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  30.94 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>