181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3321 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3321  porin  100 
 
 
285 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  96.17 
 
 
287 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  85.26 
 
 
285 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  77.62 
 
 
287 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  77.7 
 
 
296 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  80.61 
 
 
294 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  77.82 
 
 
294 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  73.79 
 
 
290 aa  364  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  73.1 
 
 
290 aa  360  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  73.1 
 
 
290 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  75 
 
 
288 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  72.66 
 
 
289 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  72.66 
 
 
289 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  74.31 
 
 
288 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  74.31 
 
 
288 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  70.95 
 
 
296 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  70.95 
 
 
296 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  61.64 
 
 
302 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  59.68 
 
 
302 aa  292  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  62.63 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  62.54 
 
 
279 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  60.94 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  62.98 
 
 
278 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  62.76 
 
 
276 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  61.11 
 
 
276 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  60.61 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  55.48 
 
 
288 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  57.38 
 
 
299 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  52.54 
 
 
279 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  53.14 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  44.33 
 
 
274 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  42.9 
 
 
283 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  42.37 
 
 
274 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  42.37 
 
 
274 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  40.2 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  40.2 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  41.84 
 
 
284 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  47.06 
 
 
287 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  41.28 
 
 
285 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  45.17 
 
 
246 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  45.07 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  37.15 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  36.13 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  37.15 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  37.25 
 
 
571 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  42.23 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  45.55 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.99 
 
 
452 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  34.81 
 
 
583 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.46 
 
 
207 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.11 
 
 
240 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  36.61 
 
 
453 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  40.87 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.78 
 
 
240 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  37.5 
 
 
250 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  34.08 
 
 
244 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  40.93 
 
 
236 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.89 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  41.86 
 
 
250 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.93 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  34.69 
 
 
447 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.51 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  30.38 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.46 
 
 
206 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.48 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  33.46 
 
 
577 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.59 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.41 
 
 
710 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  36.92 
 
 
225 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  31.25 
 
 
237 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.18 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.86 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.99 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.03 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.07 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  35 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  36.74 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  36.19 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.84 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  33.63 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.34 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  33 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  32.54 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  31.32 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  36.52 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.23 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.58 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.77 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  34.26 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  31.34 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  31.34 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.13 
 
 
692 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  34.29 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  32.73 
 
 
693 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  35.11 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.2 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.81 
 
 
570 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  35.96 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.2 
 
 
997 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>