192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1238 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  100 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  56.96 
 
 
237 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  37.45 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  37.45 
 
 
240 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  36.64 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  39.9 
 
 
225 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  35.59 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  35.24 
 
 
230 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  35.93 
 
 
228 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  35.24 
 
 
230 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  35.5 
 
 
228 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  36.02 
 
 
228 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  38.03 
 
 
454 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  41.94 
 
 
447 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  36.62 
 
 
229 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.67 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.84 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  36.74 
 
 
571 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  34.16 
 
 
652 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  34.56 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.49 
 
 
255 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  31.94 
 
 
254 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.5 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  31.91 
 
 
708 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  37.17 
 
 
452 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  34.8 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  32.21 
 
 
449 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.58 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.88 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  34.12 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  35.41 
 
 
449 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  36.71 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  32.31 
 
 
562 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  34.43 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.33 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  37.06 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.3 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.3 
 
 
453 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  35.34 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.33 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.27 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  37.97 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.05 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.56 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.2 
 
 
561 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  36.16 
 
 
710 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  34.29 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  32.33 
 
 
638 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  27.92 
 
 
300 aa  85.1  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  34.14 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  32.79 
 
 
997 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.41 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  31.43 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  27.1 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  33.19 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  32.64 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  32.73 
 
 
670 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.67 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  35.12 
 
 
703 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  33.06 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  32.11 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.38 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  30.57 
 
 
570 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  34.62 
 
 
703 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  32.99 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  31.36 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.88 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  31.8 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  36.88 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  34.62 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.5 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  34.3 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.5 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.67 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  31.47 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  34.34 
 
 
578 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  34.52 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  31.45 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  31.65 
 
 
645 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  41.41 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  30.8 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  32.22 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.51 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  31.13 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.86 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.04 
 
 
566 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.66 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.04 
 
 
692 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  27.82 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.68 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.93 
 
 
661 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.03 
 
 
570 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  34.46 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  30.95 
 
 
724 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  33.75 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.88 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  33.06 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  29.33 
 
 
665 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  30.93 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>