168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7845 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7845  porin  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  86.36 
 
 		 285 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  76.39 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  77.97 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  78.31 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  69.36 
 
 		 296 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  69.31 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  69.31 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  70.67 
 
 		 290 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  71.38 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  71.38 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  69.96 
 
 		 290 aa  341  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  69.96 
 
 		 290 aa  341  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  70.24 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  71.19 
 
 		 294 aa  338  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  70.24 
 
 		 288 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  70.24 
 
 		 288 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  64.19 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  60 
 
 		 277 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  57.69 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  58.76 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  62.2 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  60.34 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  57.44 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  55.81 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  55.77 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  54.58 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  51 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  48.11 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  51.97 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  46.13 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  42.67 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  42.38 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  43.14 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  42.05 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  42.81 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  41.13 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  41.2 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  42.57 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  44.18 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  41.79 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  43.64 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  40.64 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  35.74 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  35.09 
 
 		 583 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.35 
 
 		 207 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.55 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  40.71 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  36.94 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  36.08 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  35.36 
 
 		 571 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.33 
 
 		 240 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.22 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  34.52 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  37.4 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.33 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  35.59 
 
 		 453 aa  92  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.47 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.93 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  32.42 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  35.77 
 
 		 447 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  31.6 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.85 
 
 		 206 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.92 
 
 		 283 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.11 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  36.32 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  39.82 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.18 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  29.9 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  32.28 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.36 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.38 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  29.58 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.09 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  33.03 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.07 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  33.48 
 
 		 228 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.6 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  32.02 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.5 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  29.49 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  30.94 
 
 		 577 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  34.42 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.21 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.03 
 
 		 566 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.26 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  31.53 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  31.53 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  28.74 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.08 
 
 		 570 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.68 
 
 		 997 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.67 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  29.66 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  33.03 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  27.89 
 
 		 692 aa  68.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  29.25 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  28.11 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  30.05 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  28.87 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>