159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0701 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  89.2 
 
 
213 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  93.9 
 
 
201 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  45 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  41.05 
 
 
229 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  38.53 
 
 
230 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  38.53 
 
 
230 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  40.17 
 
 
228 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  40.47 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  39.47 
 
 
228 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  38.6 
 
 
228 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  44.15 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  38.14 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  39.22 
 
 
229 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  43.62 
 
 
211 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  41.92 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  38.61 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  39.05 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  32.77 
 
 
234 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  38.28 
 
 
204 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  36.5 
 
 
212 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.85 
 
 
207 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.6 
 
 
244 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  32.5 
 
 
254 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.67 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.5 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  36.07 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.2 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.61 
 
 
240 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  34.5 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.44 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  31.28 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  35 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.82 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.51 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  30.62 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.17 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  32.16 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  31.94 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.29 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.53 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  31.48 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  27.83 
 
 
447 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  28.82 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  25.82 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  24.17 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  29.71 
 
 
237 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.39 
 
 
258 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.57 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  36.28 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.58 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  29.61 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  29.92 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  27.98 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  26.73 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  27.7 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  26.34 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.28 
 
 
689 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  30.8 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.8 
 
 
598 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  28.1 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  30.84 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.02 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.47 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  28.74 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  33.62 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  28.27 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  31.84 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  27.91 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  25.77 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  28.09 
 
 
708 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.14 
 
 
661 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.62 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  25.1 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  28.35 
 
 
662 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  28.57 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  25.73 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  28.97 
 
 
248 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  27.84 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.86 
 
 
710 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  27.91 
 
 
670 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  30.23 
 
 
724 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  29.13 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  26.92 
 
 
570 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  27.73 
 
 
692 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.18 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.88 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  28.37 
 
 
279 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  30.32 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  28.93 
 
 
248 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  26.64 
 
 
570 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  26.94 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  27.43 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  24.37 
 
 
693 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  26.85 
 
 
578 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  29.19 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  28.64 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  25.2 
 
 
571 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.63 
 
 
246 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>