172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3299 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  100 
 
 		 287 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  93.4 
 
 		 288 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  78.12 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  80.9 
 
 		 288 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  60.41 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  61.38 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  58.55 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  54.95 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  55.56 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  55.48 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  52.52 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  57.33 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  57.33 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  53.44 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  50.33 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  48.7 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  53.17 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  52.9 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  52.9 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  52.98 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  53.17 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  53.17 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  50.98 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  50.84 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  53.04 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  53.04 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  52.7 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  50.19 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  49.64 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  46.07 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  49.68 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  44.37 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  44.37 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  37.67 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  40 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  40 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  39.72 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  38.11 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  36.21 
 
 		 571 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  40.55 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  37.8 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  41.7 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  35.94 
 
 		 583 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  34.95 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  42.49 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  34.72 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.45 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.56 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  35.29 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  40.64 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  38.25 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.55 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  33.96 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.37 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  32.18 
 
 		 207 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  32.21 
 
 		 577 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.45 
 
 		 453 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  31.84 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.47 
 
 		 206 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  34.8 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  35.31 
 
 		 452 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.88 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  34.4 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.64 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.16 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  34.5 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.73 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  33.6 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  37.33 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  31.66 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.85 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.21 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  34.44 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.67 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.42 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  32.56 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  34.76 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.41 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  34.24 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  29.93 
 
 		 997 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  32.02 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  28.7 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  37.79 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.13 
 
 		 710 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.15 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.54 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.17 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.08 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.54 
 
 		 566 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.08 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  33.8 
 
 		 693 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.87 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28.03 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  29.48 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.92 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  28.73 
 
 		 692 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  29.73 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  32.82 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  30.69 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>